RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240100.6

DUSP4-201, Transcript of dual specificity phosphatase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP4, Length 5,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4-201ENST00000240100 SYNJ1O43426 1573 aa21.65■■□□□ 1.06
DUSP4-201ENST00000240100 FAM161AQ3B820 660 aa21.65■■□□□ 1.06
DUSP4-201ENST00000240100 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.64■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 E9PSI1 815 aa21.64■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 NCAPD3P42695 1498 aa21.64■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.63■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.63■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.63■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.62■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 NCOA2Q15596 1464 aa21.61■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 SOX12O15370 315 aa21.61■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 NGEFQ8N5V2 710 aa21.61■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 ARAP1Q96P48 1450 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 MLECQ14165 292 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 HMMRO75330 724 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 MIA2Q96PC5 1412 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.6■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 APBB1O00213 710 aa21.59■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 CRBNQ96SW2 442 aa21.58■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
DUSP4-201ENST00000240100 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 STK31Q9BXU1 1019 aa21.57■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 PTPRGP23470 1445 aa21.56■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 TOP2BQ02880 1626 aa21.56■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.55■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 PLIN1O60240 522 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 DRC7Q8IY82 874 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP4-201ENST00000240100 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 PRXQ9BXM0 1461 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 STAC3Q96MF2 364 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 EVC2Q86UK5 1308 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 PRDM2Q13029 1718 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 GPATCH3Q96I76 525 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 TIAM1Q13009 1591 aa21.47■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 CFTRP13569 1480 aa21.47■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 ST18O60284 1047 aa21.47■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.46■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 GSE1Q14687 1217 aa21.46■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.46■■□□□ 1.03
DUSP4-201ENST00000240100 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.43■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 APAF1O14727 1248 aa21.43■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.42■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 AAMPQ13685 434 aa21.42■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 COG6Q9Y2V7 657 aa21.41■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 PHF14O94880 888 aa21.4■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.4■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 OSCARQ8IYS5 282 aa21.39■■□□□ 1.02
DUSP4-201ENST00000240100 HFM1A2PYH4 1435 aa21.39■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.38■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 RUNDC1Q96C34 613 aa21.37■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.36■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 HMGXB3Q12766 1538 aa21.36■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.36■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 SLC4A3P48751 1232 aa21.36■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.35■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 HECW1Q76N89 1606 aa21.35■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 EID1Q9Y6B2 187 aa21.35■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 GRIN2BQ13224 1484 aa21.34■■□□□ 1.01
DUSP4-201ENST00000240100 NPHP1O15259 732 aa21.33■■□□□ 1.01
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DUSP4-201ENST00000240100 TPM4P67936 248 aa21.33■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.32■■□□□ 1
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DUSP4-201ENST00000240100 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 ROCK1Q13464 1354 aa21.3■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.3■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 KIF16BQ96L93 1317 aa21.29■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.27■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.27■■□□□ 1
DUSP4-201ENST00000240100 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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DUSP4-201ENST00000240100 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
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