RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231357.6

IRX4-201, Transcript of iroquois homeobox 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,221 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4-201ENST00000231357 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.43■■■□□ 2.3
IRX4-201ENST00000231357 SHROOM2Q13796 1616 aa29.43■■■□□ 2.3
IRX4-201ENST00000231357 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
IRX4-201ENST00000231357 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
IRX4-201ENST00000231357 UNC13BO14795 1591 aa29.41■■■□□ 2.3
IRX4-201ENST00000231357 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.39■■■□□ 2.3
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IRX4-201ENST00000231357 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.36■■■□□ 2.29
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IRX4-201ENST00000231357 PLA2R1Q13018 1463 aa29.33■■■□□ 2.29
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IRX4-201ENST00000231357 NUDCQ9Y266 331 aa29.32■■■□□ 2.28
IRX4-201ENST00000231357 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
IRX4-201ENST00000231357 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.31■■■□□ 2.28
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IRX4-201ENST00000231357 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
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IRX4-201ENST00000231357 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.23■■■□□ 2.27
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IRX4-201ENST00000231357 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.22■■■□□ 2.27
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IRX4-201ENST00000231357 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
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IRX4-201ENST00000231357 PLCH2O75038 1416 aa29.17■■■□□ 2.26
IRX4-201ENST00000231357 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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IRX4-201ENST00000231357 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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IRX4-201ENST00000231357 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.1■■■□□ 2.25
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IRX4-201ENST00000231357 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.94■■■□□ 2.22
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IRX4-201ENST00000231357 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
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IRX4-201ENST00000231357 INSRP06213 1382 aa28.9■■■□□ 2.22
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IRX4-201ENST00000231357 IQGAP1P46940 1657 aa28.88■■■□□ 2.21
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IRX4-201ENST00000231357 CEP152O94986 1710 aa28.87■■■□□ 2.21
IRX4-201ENST00000231357 PTPRTO14522 1441 aa28.87■■■□□ 2.21
IRX4-201ENST00000231357 CLTCL1P53675 1640 aa28.85■■■□□ 2.21
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IRX4-201ENST00000231357 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.8■■■□□ 2.2
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IRX4-201ENST00000231357 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
IRX4-201ENST00000231357 ATP7AQ04656 1500 aa28.8■■■□□ 2.2
IRX4-201ENST00000231357 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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IRX4-201ENST00000231357 STAC3Q96MF2 364 aa28.79■■■□□ 2.2
IRX4-201ENST00000231357 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.78■■■□□ 2.2
IRX4-201ENST00000231357 FANCAO15360 1455 aa28.77■■■□□ 2.2
IRX4-201ENST00000231357 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.77■■■□□ 2.2
IRX4-201ENST00000231357 KANK1Q14678 1352 aa28.75■■■□□ 2.19
IRX4-201ENST00000231357 SYNMO15061 1565 aa28.75■■■□□ 2.19
IRX4-201ENST00000231357 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.74■■■□□ 2.19
IRX4-201ENST00000231357 CDCA8Q53HL2 280 aa28.73■■■□□ 2.19
IRX4-201ENST00000231357 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
IRX4-201ENST00000231357 PPP2R1AP30153 589 aa28.69■■■□□ 2.18
IRX4-201ENST00000231357 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.69■■■□□ 2.18
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