RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 KIF15Q9NS87 1388 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 GSE1Q14687 1217 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 NEUROD2Q15784 382 aa21.96■■□□□ 1.11
CTDP1-201ENST00000075430 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 GRIN2AQ12879 1464 aa21.95■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 RALBP1Q15311 655 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 ADAMTS12P58397 1594 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 WDR62O43379 1518 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 DISP1Q96F81 1524 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.9■■□□□ 1.1
CTDP1-201ENST00000075430 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 PBRM1Q86U86 1689 aa21.88■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 PTPRGP23470 1445 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGEF11O15085 1522 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 ROCK1Q13464 1354 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDP1-201ENST00000075430 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 MS4A1P11836 297 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 USP35Q9P2H5 1018 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 BCAR3O75815 825 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 KIAA0556O60303 1618 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDP1-201ENST00000075430 PDE3BQ13370 1112 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 FAM161AQ3B820 660 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 APAF1O14727 1248 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 SYNJ2O15056 1496 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 POGKQ9P215 609 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 COG6Q9Y2V7 657 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 PZPP20742 1482 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA2Q08379 1002 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 KIF14Q15058 1648 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 PANK1Q8TE04 598 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 TMF1P82094 1093 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDP1-201ENST00000075430 ATP10BO94823 1461 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 SEC24BO95487 1268 aa21.69■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 C8orf34Q49A92 452 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 AFAP1Q8N556 730 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGHDP01880 384 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 CEP170Q5SW79 1584 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDP1-201ENST00000075430 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDP1-201ENST00000075430 PPP2R1AP30153 589 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-201ENST00000075430 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.62■■□□□ 1.05
CTDP1-201ENST00000075430 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.6■■□□□ 1.05
CTDP1-201ENST00000075430 TNNQ9UQP3 1299 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDP1-201ENST00000075430 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 KIF3BO15066 747 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 TESK2Q96S53 571 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDP1-201ENST00000075430 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 BECN1Q14457 450 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 KDM5CP41229 1560 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 NUP160Q12769 1436 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 SLFN5Q08AF3 891 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 GGT6Q6P531 493 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 PANK2Q9BZ23 570 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDP1-201ENST00000075430 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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