RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 WrnO09053 1401 aa19.14■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc146E9Q9F7 977 aa19.14■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Inpp5dQ9ES52 1191 aa19.14■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ppm1fQ8CGA0 452 aa19.13■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pde3bQ61409 1100 aa19.12■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stk31Q99MW1 1018 aa19.12■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ciz1Q8VEH2 845 aa19.09■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa19.08■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Shroom4Q1W617 1475 aa19.08■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa19.08■□□□□ 0.65
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc60Q8C4J0 545 aa19.08■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ipo9Q91YE6 1041 aa19.07■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm973E9Q295 1059 aa19.07■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rsph4aQ8BYM7 716 aa19.06■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AppP12023 770 aa19.06■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 UacaQ8CGB3 1411 aa19.06■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kif7B7ZNG0 1348 aa19.05■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stard8Q8K031 1019 aa19.05■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa19.05■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Soga1E1U8D0 1418 aa19.05■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smarca2Q6DIC0 1577 aa19.04■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19.03■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ChgaP26339 463 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 R3hcc1Q8BSI6 488 aa19.03■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnai2A2AC93 623 aa19.03■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa19.02■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chrna2Q91X60 512 aa19.02■□□□□ 0.64
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GsdmaQ9EST1 446 aa19.01■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bcl11bQ99PV8 884 aa19.01■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tdrd9Q14BI7 1383 aa19■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vps53Q8CCB4 832 aa18.99■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tomm22Q9CPQ3 142 aa18.98■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Irx3P81067 507 aa18.98■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pip4k2bQ80XI4 416 aa18.98■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam184bQ0KK56 942 aa18.96■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncoa2Q61026 1462 aa18.96■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tpd52l1O54818 204 aa18.96■□□□□ 0.63
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Crybg2B7ZCC2 1516 aa18.95■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccer1Q9CQL2 403 aa18.94■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa18.94■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ErbinQ80TH2 1402 aa18.94■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dapk1Q80YE7 1442 aa18.94■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fyb1O35601 819 aa18.94■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Esx1O88933 382 aa18.93■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Jph4Q80WT0 628 aa18.93■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gpatch11Q3UFS4 262 aa18.93■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rock1P70335 1354 aa18.93■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SlkO54988 1233 aa18.92■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chmp7Q8R1T1 451 aa18.92■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa18.92■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AU015836B2RUM3 263 aa18.91■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Triml2E9PW10 424 aa18.9■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MsnP26041 577 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zscan10Q3URR7 782 aa18.88■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cgnl1Q6AW69 1298 aa18.88■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chmp4cQ9D7F7 232 aa18.87■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bcl2l13P59017 434 aa18.87■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp16Q99LG0 825 aa18.87■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tceal9Q9DD24 104 aa18.86■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BccipQ9CWI3 316 aa18.85■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp6v1dP57746 247 aa18.85■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BcanQ61361 883 aa18.85■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rad54l2Q99NG0 1466 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gsto1O09131 240 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nectin2P32507 530 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Calcoco2A2A6M5 331 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ttll5Q8CHB8 1328 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ScribQ80U72 1612 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Neurod6P48986 337 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smc4Q8CG47 1286 aa18.84■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa18.83■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp644E9QA22 1323 aa18.83■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cux1P53564 1515 aa18.83■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q9D9H8 365 aa18.83■□□□□ 0.61
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nutm1Q8BHP2 1126 aa18.83■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 RdxP26043 583 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kiaa0754Q69ZZ9 979 aa18.82■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rfx1P48377 963 aa18.81■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FosbP13346 338 aa18.81■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ric3Q8BPM6 367 aa18.81■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bcl11aQ9QYE3 773 aa18.8■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arhgap5P97393 1501 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.8 ms