RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028347.12

Rbms1-201, Transcript of RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbms1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa15.6■□□□□ 0.09
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Hap1O35668 628 aa15.59■□□□□ 0.09
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa15.57■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa15.57■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Mettl14Q3UIK4 456 aa15.57■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 DmtnQ9WV69 405 aa15.56■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 FosbP13346 338 aa15.55■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Mtus2Q3UHD3 1353 aa15.54■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Frmd4bQ920B0 1035 aa15.52■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ipo8Q7TMY7 1010 aa15.52■□□□□ 0.08
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Rnf216P58283 853 aa15.51■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Atf5O70191 283 aa15.5■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Calr4Q3TQS0 420 aa15.5■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ccdc69Q3TCJ8 202 aa15.49■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Kif27Q7M6Z4 1394 aa15.49■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Skor2A7M7C7 1008 aa15.48■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ralbp1Q62172 648 aa15.48■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ppme1Q8BVQ5 386 aa15.48■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Nap1l5Q9JJF0 156 aa15.48■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Arid3cA6PWV5 409 aa15.47■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 IqubQ8CDK3 788 aa15.47■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gm20521D3Z5F7 333 aa15.47■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Card11Q8CIS0 1159 aa15.47■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Plagl1Q9JLQ4 704 aa15.47■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Stk24Q99KH8 431 aa15.46■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Wdhd1P59328 1117 aa15.45■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 NgefQ8CHT1 710 aa15.45■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Cux2P70298 1426 aa15.45■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Slc7a3P70423 618 aa15.45■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ppm1eQ80TL0 749 aa15.44■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ak7Q9D2H2 614 aa15.44■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa15.44■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 AknaQ80VW7 1404 aa15.43■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Slc24a3Q99PD7 645 aa15.43■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Trim30cD3YVI9 513 aa15.42■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pdcl3Q8BVF2 240 aa15.42■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 CadpsQ80TJ1 1355 aa15.41■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Frmpd1A2AKB4 1549 aa15.41■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Mia2Q91ZV0 1396 aa15.41■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Baz1bQ9Z277 1479 aa15.41■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Spock2Q9ER58 423 aa15.4■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 StimateQ3UF25 288 aa15.39■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Arhgap35Q91YM2 1499 aa15.39■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 R3hcc1Q8BSI6 488 aa15.39■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 PtprkP35822 1457 aa15.38■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gimap8Q75N62 688 aa15.38■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Map4P27546 1125 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Rpap1Q80TE0 1409 aa15.37■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Znf330Q922H9 316 aa15.36■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Spink5Q148R4 1017 aa15.35■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Plekhg5Q66T02 1073 aa15.35■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Armcx1Q9CX83 456 aa15.34■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zc3h4Q6ZPZ3 1304 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ofd1Q80Z25 1017 aa15.33■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Cabp1Q9JLK7 227 aa15.33■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Shroom4Q1W617 1475 aa15.33■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pkd2O35245 966 aa15.33■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Stk3Q9JI10 497 aa15.33■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Cluap1Q8R3P7 413 aa15.32■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gm10354K7N6A0 256 aa15.31■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ccdc173A0JLY1 547 aa15.31■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Speer4eK7N6S8 255 aa15.3■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Vps37dQ810I0 261 aa15.3■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Lemd3Q9WU40 921 aa15.29■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Fam117aQ7TNF9 451 aa15.29■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Chrna2Q91X60 512 aa15.29■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa15.28■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Wdr62Q3U3T8 1523 aa15.28■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Tnnt2P50752 301 aa15.28■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Arap1Q4LDD4 1452 aa15.28■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Trak1Q6PD31 939 aa15.27■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Carmil1Q6EDY6 1374 aa15.27■□□□□ 0.04
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa15.27■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 NrkQ9R0G8 1455 aa15.27■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 PdiltQ9DAN1 588 aa15.26■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Cnga1P29974 684 aa15.26■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 CntlnA2AM05 1397 aa15.26■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Tmc1Q8R4P5 757 aa15.25■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Erich4Q3UNU4 136 aa15.25■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gtf2a1Q99PM3 378 aa15.25■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Fyco1Q8VDC1 1437 aa15.24■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gm7361D3Z6R1 267 aa15.24■□□□□ 0.03
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.2 ms