RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	RAD7	P06779	565 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	NUP2	P32499	720 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SKT5	P34226	696 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YKL162C	P36052	402 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RIM2	P38127	377 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SUL1	P38359	859 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MIT1	P40002	666 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	AGP3	P43548	558 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPC17	P47076	161 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RMR1	P53060	241 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	OKP1	P53298	406 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	GPI1	P53306	609 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	GIS1	Q03833	894 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SMP3	Q04174	516 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	NAT4	Q04751	285 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	AIM39	Q08223	395 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BI2	P03873	423 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BAR1	P12630	587 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	STE18	P18852	110 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	RPO26	P20435	155 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ERG9	P29704	444 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	COX13	P32799	129 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PTR2	P32901	601 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PPS1	P38148	807 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	LDB7	P38210	180 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	ARN1	P38731	627 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BIG1	P38813	335 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PFS1	P38872	237 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	EXO1	P39875	702 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SDS3	P40505	327 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	DSN1	P40568	576 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	NAS6	P50086	228 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	PKP2	P53170	491 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SOL4	P53315	255 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	BUD32	P53323	261 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	TMA10	Q06177	86 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	SSK1	Q07084	712 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	IMA2	Q08295	589 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	CSM4	Q08955	156 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	MSH5	Q12175	901 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RPS1B	YML063W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	HEM2	P05373	342 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	EXO70	P19658	623 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RPB8	P20436	146 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	BUB3	P26449	341 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	PEX3	P28795	441 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	MYO3	P36006	1272 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	FLO10	P36170	1169 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YPK3	P38070	525 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	TDA11	P38854	504 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	FHL1	P39521	936 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	DSE1	P40077	573 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YIL060W	P40519	144 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YIL001W	P40560	513 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	HMS2	P47175	358 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	DIA1	P54005	336 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RTT103	Q05543	409 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YOR389W	Q08912	624 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YLR108C	Q12259	485 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RRI1	Q12468	440 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	TPK3	P05986	398 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	RIB1	P38066	345 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	MRX3	P38172	270 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	IST2	P38250	946 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	SMF2	P38778	549 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.95	□□□□□ -1.78	not detected
RPS1B	YML063W	RBG1	P39729	369 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	YEL020C	P39994	560 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RPS1B	YML063W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78

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