RNA–Protein interactions for RNA: YLR265C

NEJ1, Transcript of Protein involved in regulation of nonhomologous end joining, yeast

Gene NEJ1, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEJ1	YLR265C	UBA3	Q99344	299 aa		2.84	□□□□□ -1.95
NEJ1	YLR265C	FLO11	P08640	1367 aa		2.84	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	MDL1	P33310	695 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	TIP20	P33891	701 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	SPO73	P40031	143 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	UFE1	P41834	346 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	MOB2	P43563	287 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	EPL1	P43572	832 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	INP2	Q03824	705 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	YFH1	Q07540	174 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	PEX27	Q08580	376 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	MMT2	Q08970	484 aa		2.83	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	AIM33	Q04516	312 aa		2.82	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.82	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	CKA2	P19454	339 aa		2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	COS4	P43542	379 aa		2.81	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	COX10	P21592	462 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	SRB2	P34162	210 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	YBL028C	P38202	106 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	LST7	P53237	242 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	ALE1	Q08548	619 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	YDR018C	Q12185	396 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	FSH3	Q99369	266 aa		2.8	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.79	□□□□□ -1.96	not detected
NEJ1	YLR265C	ATG7	P38862	630 aa		2.79	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	SNL1	P40548	159 aa		2.79	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	BDH1	P39714	382 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	NAS6	P50086	228 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	PRM1	P53835	661 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	FAR10	Q06001	478 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	HRT1	Q08273	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	YDL211C	Q12121	372 aa		2.78	□□□□□ -1.96
NEJ1	YLR265C	GRR1	P24814	1151 aa		2.77	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	PEX5	P35056	612 aa		2.77	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YIL059C	P40520	121 aa		2.77	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	SMP3	Q04174	516 aa		2.77	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	APC4	Q04601	652 aa		2.77	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	URA10	P30402	227 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	TAE1	P38340	232 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	EFM1	P38732	585 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	RBG1	P39729	369 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	MPS2	P53159	387 aa		2.76	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	CKI1	P20485	582 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	IST2	P38250	946 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YSW1	P38280	609 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YNL320W	P42840	284 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YFR018C	P43599	363 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	VTI1	Q04338	217 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	CSM3	Q04659	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	DAP2	P18962	818 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	PUP2	P32379	260 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YMR262W	P38430	313 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YJL144W	P47009	104 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YNR068C	P53754	272 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	TAF10	Q12030	206 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	SFG1	Q12507	346 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	MKK1	P32490	508 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	MRPS5	P33759	307 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YKL071W	P36086	256 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	NRM1	P53718	249 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YOR012W	Q12351	137 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	RPN6	Q12377	434 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	SAL1	D6W196	494 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	CUP2	P15315	225 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	PCH2	P38126	564 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	RRG9	P40156	214 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	JEM1	P40358	645 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	YCH1	P42937	148 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	GMC1	Q04399	608 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	NAT4	Q04751	285 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	ECM19	Q06011	112 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEJ1	YLR265C	VPS63	O13549	108 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	CPT1	P17898	393 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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