RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	TOM1	Q03280	3268 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ECT1	P33412	323 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.27	□□□□□ -2.05	not detected
YLR224W	YLR224W	DAD2	P36162	133 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	WSC4	P38739	605 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RRF1	P38771	230 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YHR182W	P38870	785 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PEX22	P39718	180 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	HEM14	P40012	539 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SNL1	P40548	159 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	AGX1	P43567	385 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FSH2	Q05015	223 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YLR177W	Q06251	628 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YLH47	Q06493	454 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	LDB17	Q12342	491 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FRE6	Q12473	712 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	VPS15	P22219	1454 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	UNG1	P12887	359 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PPQ1	P32945	549 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YKR015C	P36111	568 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ATP16	Q12165	160 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YOR338W	Q99326	363 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FAB1	P34756	2278 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YPK9	Q12697	1472 aa		2.26	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	DAP2	P18962	818 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	DAL80	P26343	269 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	NTG1	P31378	399 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	COS9	P36034	407 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	HSM3	P38348	480 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	CHL4	P38907	458 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YJR030C	P47101	745 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FLC3	P53121	802 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YNR068C	P53754	272 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RNH201	P53942	307 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	INP2	Q03824	705 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	AIM33	Q04516	312 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YDR115W	Q04598	105 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FSH3	Q99369	266 aa		2.25	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	MAS1	P10507	462 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PUT4	P15380	627 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	MRPL25	P23369	157 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPC37	P36121	282 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YBR241C	P38142	488 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	CTM1	P38818	585 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SPT8	P38915	602 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	AIM20	P40451	204 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YFL012W	P43580	148 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	BIO3	P50277	480 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SLT2	Q00772	484 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RRN5	Q02983	363 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SPH1	Q06160	661 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YOR376W	Q08900	122 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	MDY2	Q12285	212 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SFG1	Q12507	346 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	UBA3	Q99344	299 aa		2.24	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	OM45	P16547	393 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	FAR1	P21268	830 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RDS1	P25611	832 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	HMX1	P32339	317 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YUH1	P35127	236 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SHE1	P38200	338 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.2 ms