RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	SWH1	P35845	1188 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YHR180W	P38868	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YHR218W	P38899	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	SEN34	P39707	275 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MPM1	P40364	252 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	SNM1	P40993	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YGR201C	P42936	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YFL051C	P43552	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	NIT2	P47016	307 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MON1	P53129	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	INN1	P53901	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	ARO10	Q06408	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	DFG16	Q99234	619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MRP10	O75012	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	HEM4	P06174	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	PDX1	P16451	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	PEX6	P33760	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YHL037C	P38733	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MET28	P40573	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	HXT9	P40885	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YJR142W	P47173	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MSY1	P48527	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	SHE4	P51534	789 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	HXT11	P54862	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RNH202	Q05635	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	COQ11	Q05892	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MRL1	Q06815	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RRT8	Q08219	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	CRT10	Q08226	957 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	THP1	Q08231	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	OSW1	Q08692	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	HNT3	Q08702	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YIG1	Q08956	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	GRE1	Q08969	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	BTS1	Q12051	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
MRP17	YKL003C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	TFS1	P14306	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	REC107	P21651	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YCR100C	P25606	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	ATP7	P30902	174 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	DEP1	P31385	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	COS9	P36034	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	CIN4	P39110	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	GAT2	P40209	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	NUP57	P48837	541 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MIG2	P53035	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	YGR126W	P53274	230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	MEP3	P53390	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	SNF12	P53628	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	GPI11	Q06636	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	VPS36	Q06696	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RAF1	Q06891	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	PSR1	Q07800	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RSA1	Q08932	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRP17	YKL003C	RAD7	P06779	565 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RPB8	P20436	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	UTR1	P21373	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HSP30	P25619	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	COQ2	P32378	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	HIR2	P32480	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SKG1	P36169	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RIB1	P38066	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YEL068C	P39977	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	GPI1	P53306	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	SPR6	Q01684	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	MRX4	Q12467	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRP17	YKL003C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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