RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	SEI1	Q06058	285 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	YPS7	Q06325	596 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	YOR376W	Q08900	122 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	NPC2	Q12408	173 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	HSP150	P32478	413 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	HIR2	P32480	875 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	SIC1	P38634	284 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	NSG1	P38837	291 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	PEX18	P38855	283 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	YIL067C	P40514	678 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	URC2	Q04411	772 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	CDA2	Q06703	312 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	YOR214C	Q12282	236 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RRP4	YHR069C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	CPR3	P25719	182 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	LYP1	P32487	611 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ECM15	P35195	104 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	MCM7	P38132	845 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	OM14	P38325	134 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	CTF8	P38877	133 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	SKN7	P38889	622 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
RRP4	YHR069C	SER3	P40054	469 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	CIN1	P40987	1014 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	SHR5	P41912	237 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	QRI7	P43122	407 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YFR054C	P43622	192 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	SNF12	P53628	566 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	RSN1	Q03516	953 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	SMP3	Q04174	516 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	DFG16	Q99234	619 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	FAR1	P21268	830 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	NAM9	P27929	486 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	EXO84	P38261	753 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	PIC2	P40035	300 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YGL235W	P53071	178 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YGR168C	P53293	376 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	COG5	P53951	403 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YSA1	Q01976	231 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	NUP53	Q03790	475 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.2	□□□□□ -1.58	not detected
RRP4	YHR069C	YOS9	Q99220	542 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	TPK3	P05986	398 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YOL162W	P0CF19	215 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	TFS1	P14306	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ERD2	P18414	219 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	RPC82	P32349	654 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YKL077W	P36081	392 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	TAT1	P38085	619 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	RPP1	P38786	293 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ASI1	P54074	624 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YKR011C	Q02209	353 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ABZ2	Q03266	374 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	YDR209C	Q03480	137 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	DCR2	Q05924	578 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	CYK3	Q07533	885 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RRP4	YHR069C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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