RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	AI4	P03878	556 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YOL162W	P0CF19	215 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	BAR1	P12630	587 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	CDC26	P14724	124 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DAL82	P21705	255 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PMT2	P31382	759 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PUP2	P32379	260 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	ORC2	P32833	620 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YHR219W	P38900	624 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	DDI1	P40087	428 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NTA1	P40354	457 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YGL101W	P53144	215 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YGR067C	P53243	804 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NCE101	Q02820	53 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	INP1	Q03694	420 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	FMP42	Q04991	504 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	NEJ1	Q06148	342 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	FMP45	Q07651	309 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	PIN2	Q12057	282 aa		10.03	□□□□□ -0.8
DDR2	YOL052C-A	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	STP22	P25604	385 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	BAP2	P38084	609 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ALG3	P38179	458 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	BUR6	P40096	142 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YIL166C	P40445	542 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YLR460C	P54007	376 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SYO1	Q07395	620 aa		10.02	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YCR100C	P25606	316 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SEC61	P32915	480 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	MDM31	P38880	579 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YHR210C	P38893	341 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	MBP1	P39678	833 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YNL195C	P40168	261 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	MDV1	P47025	714 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YGL235W	P53071	178 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ASI1	P54074	624 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	GAL83	Q04739	417 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YPQ2	Q06328	317 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	NTG2	Q08214	380 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	UIP4	Q08926	304 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		10.01	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SAC7	P17121	654 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SNC1	P31109	117 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SEA4	P38164	1038 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ZRG8	P40021	1076 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	MDE1	P47095	244 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YJR098C	P47139	656 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SHE4	P51534	789 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	LCL3	P53153	274 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	NUP49	Q02199	472 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SNZ1	Q03148	297 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	TFB3	Q03290	321 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ELP6	Q04868	273 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	VID22	Q05934	901 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YLR040C	Q07988	224 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	GSH2	Q08220	491 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SPC3	Q12133	184 aa		10	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	COX1	P00401	534 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	CLB2	P24869	491 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	LYP1	P32487	611 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YPT7	P32939	208 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YKL077W	P36081	392 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	FMP23	P38231	175 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	OCA5	P38738	679 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	LEM3	P42838	414 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	EFM3	P47163	339 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	BUD17	P53727	317 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YAT1	P80235	687 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	YPR127W	Q06494	345 aa		9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	REP1	P03871	373 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.98	□□□□□ -0.81	not detected
DDR2	YOL052C-A	ERD2	P18414	219 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	MCM7	P38132	845 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	UBS1	P38290	277 aa		9.98	□□□□□ -0.81
DDR2	YOL052C-A	SHR5	P41912	237 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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