RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	SLX1	P38324	304 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	MKC7	P53379	596 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PSK1	P31374	1356 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	CMK2	P22517	447 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	WSC4	P38739	605 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	KEG1	P43614	200 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YJR030C	P47101	745 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PRM1	P53835	661 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	SMP3	Q04174	516 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	FSH2	Q05015	223 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	GRR1	P24814	1151 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	LDS1	P31379	325 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	SMI1	P32566	505 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YKR015C	P36111	568 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	SOL2	P37262	315 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	MRP21	P38175	177 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	CAJ1	P39101	391 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YIL089W	P40500	205 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	EFM3	P47163	339 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YGR016W	P53209	190 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	MCT1	Q12283	360 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	SFM1	Q12314	213 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	CKI1	P20485	582 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	SAG1	P20840	650 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	RBG1	P39729	369 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YPS5	P53057	165 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	LST7	P53237	242 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	KTR6	P54070	446 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	GAS2	Q06135	555 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ARR1	Q06596	294 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	APC5	Q08683	685 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YEL043W	P32618	956 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	MID2	P36027	376 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	COS9	P36034	407 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	BMT2	P38278	337 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	HEM14	P40012	539 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YHC3	P47040	408 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YGL262W	P53054	175 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	VAC7	P53950	1165 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YDR286C	Q05530	114 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YLR177W	Q06251	628 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ATP16	Q12165	160 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PSY3	Q12318	242 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	UBA3	Q99344	299 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	FAR1	P21268	830 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	HXT2	P23585	541 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ANP1	P32629	500 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	MRPS5	P33759	307 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	UIP5	P36137	443 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PEX22	P39718	180 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	HST1	P53685	503 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	NAT4	Q04751	285 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	MXR2	P25566	168 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	YBR241C	P38142	488 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	YHR122W	P38829	231 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	ATG7	P38862	630 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	PGU1	P47180	361 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	VHT1	P53241	593 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	VHS1	Q03785	461 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	YDR115W	Q04598	105 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	MCH1	Q07376	486 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	PGC1	Q08959	321 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	HIF1	Q12373	385 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	UNG1	P12887	359 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	ALP1	P38971	573 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	AIM23	P47015	356 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	SLT2	Q00772	484 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL171C	YNL171C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.19	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37 ms