RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TRM9	YML014W	IRA2	P19158	3079 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	COX1	P00401	534 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	MET17	P06106	444 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SAM35	P14693	329 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	TEC1	P18412	486 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	STE4	P18851	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SEA4	P38164	1038 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	ALP1	P38971	573 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	LCL3	P53153	274 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	COS1	P53822	381 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RNH1	Q04740	348 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	CRT10	Q08226	957 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	TPO4	Q12256	659 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	VCX1	Q99385	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SNF6	P18888	332 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	OAC1	P32332	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	ORC2	P32833	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	ARN2	P38724	620 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YIL166C	P40445	542 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SHR5	P41912	237 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	LEM3	P42838	414 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	HMS2	P47175	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YGL101W	P53144	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YLR446W	Q06204	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SIA1	Q12212	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YOS9	Q99220	542 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YOL162W	P0CF19	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SAC7	P17121	654 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	LEU5	P38702	357 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YHR219W	P38900	624 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	TFB3	Q03290	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SYO1	Q07395	620 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YOL073C	Q08232	322 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	PNS1	Q12412	539 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SNC1	P31109	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	MDE1	P47095	244 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YJR098C	P47139	656 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	PMT3	P47190	753 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	TRS23	Q03784	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YCR100C	P25606	316 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	CWH43	P25618	953 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YPT7	P32939	208 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YNL195C	P40168	261 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	IRC5	P43610	853 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YJR115W	P47152	169 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YGL235W	P53071	178 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	GRX5	Q02784	150 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YPQ2	Q06328	317 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	UIP4	Q08926	304 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	HER1	Q12276	1246 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	FLP1	P03870	423 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	NSG1	P38837	291 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	MDM31	P38880	579 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	NTA1	P40354	457 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	CUP9	P41817	306 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	ASI1	P54074	624 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	SPC3	Q12133	184 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TRM9	YML014W	ENA1	P13587	1091 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	ERD2	P18414	219 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	YKL077W	P36081	392 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	MCM7	P38132	845 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	ZRG8	P40021	1076 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	BUR6	P40096	142 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	ENA2	Q01896	1091 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	PEX25	Q02969	394 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	SNZ1	Q03148	297 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	NEJ1	Q06148	342 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	YPR127W	Q06494	345 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	BDS1	Q08347	646 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	ENA5	Q12691	1091 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TRM9	YML014W	LSO1	Q3E827	93 aa		11.58	□□□□□ -0.56

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