RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W TY2A-DR1Q12392 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W HMS1Q12398 434 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-OR1Q12439 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TY2A-DR3Q99303 438 aa3.65□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.64□□□□□ -1.83not detected
HCA4YJL033W ASP3-2P0CX77 362 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ASP3-3P0CX78 362 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ASP3-4P0CX79 362 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ASP3-1P0CZ17 362 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MAS2P11914 482 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W HNM1P19807 563 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W URA7P28274 579 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SRB2P34162 210 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ASK1P35734 292 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W JEN1P36035 616 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PCA1P38360 1216 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PHO89P38361 574 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MLH1P38920 769 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W UME6P39001 836 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.64□□□□□ -1.83not detected
HCA4YJL033W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TIM13P53299 105 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ARL3Q02804 198 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CSN9Q03981 162 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PRM6Q04705 352 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GMC2Q06201 188 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MHR1Q06630 226 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NDE2Q07500 545 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GSH2Q08220 491 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MCH4Q08268 501 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MUM3Q08750 479 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W LAG2Q92325 660 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RAD7P06779 565 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W UGA1P17649 471 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ART10P18634 518 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CCA1P21269 546 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GIT1P25346 518 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GID7P25569 745 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PTC1P35182 281 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TVP38P36164 337 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MSR1P38714 643 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RRP4P38792 359 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SEN34P39707 275 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YER184CP39961 794 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W AGE2P40529 298 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W HXT9P40885 567 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SER2P42941 309 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W BNA6P43619 295 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CUL3P53202 744 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W REG1Q00816 1014 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PFA5Q03289 374 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SNX41Q04053 625 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W BUR2Q05949 395 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ATX2Q12067 313 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YOR012WQ12351 137 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RPN6Q12377 434 aa3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YCR006CP25350 157 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ARO7P32178 256 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W FRE1P32791 686 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W VAM7P32912 316 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W VPS17P32913 551 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SKG1P36169 355 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MRPL3P36516 390 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W SCO2P38072 301 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YBR056WP38081 501 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W FHL1P39521 936 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NDE1P40215 560 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GPI8P49018 411 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W UBP8P50102 471 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RCF2P53721 224 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YNL033WP53964 284 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YNL019CP53975 284 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W NHP10Q03435 203 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W TRM82Q03774 444 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W HSP31Q04432 237 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W RNH1Q04740 348 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W MFB1Q04922 465 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CRN1Q06440 651 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YPD1Q07688 167 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W ENT4Q07872 247 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YLR049CQ12110 428 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W YOL107WQ12239 342 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W PCD1Q12524 340 aa3.63□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W GCN4P03069 281 aa3.62□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
HCA4YJL033W CHS1P08004 1131 aa3.62□□□□□ -1.83
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