RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	ROG1	P53118	685 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MNT4	P53745	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PNG1	Q02890	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	HEH2	Q03281	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RNH202	Q05635	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	VID22	Q05934	901 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RAX1	Q08760	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MDM35	O60200	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PET54	P10834	293 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SEC12	P11655	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	AHC2	P25649	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SSH4	P32343	579 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MKK1	P32490	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	KKQ8	P36004	724 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MNN2	P38069	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TAT1	P38085	619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MET28	P40573	187 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	AAD14	P42884	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	COS10	P52924	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MAL11	P53048	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	EMC4	P53073	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YGR079W	P53249	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	ATF2	P53296	535 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	XYL2	Q07993	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YNG1	Q08465	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RAD59	Q12223	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SUL2	Q12325	893 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	ATG31	Q12421	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PCL9	Q12477	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MSB2	P32334	1306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	STT4	P37297	1900 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SIR2	P06700	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	HOP1	P20050	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	KIN3	P22209	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PEX1	P24004	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YJU3	P28321	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	KRE6	P32486	720 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MRPL3	P36516	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MCM7	P38132	845 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CCZ1	P38273	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
UBX7	YBR273C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	FAU1	P40099	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	HXT9	P40885	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MRPS18	P42847	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	PRM10	P42946	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	APS3	P47064	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	NUP57	P48837	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YNL034W	P53963	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	AAT1	Q01802	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ISU1	Q03020	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ELP6	Q04868	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BUR2	Q05949	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MLC2	Q06580	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	IPK1	Q06667	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	BSC1	Q12140	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SPS2	P08459	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	MET2	P08465	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SNF6	P18888	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	APN1	P22936	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	ERG9	P29704	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	JEN1	P36035	616 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
UBX7	YBR273C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YRO2	P38079	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	RRN10	P38204	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	YBR137W	P38276	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBX7	YBR273C	TAT2	P38967	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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