RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	YCL002C	P25565	263 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YCR102C	P25608	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BEM3	P32873	1128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	APL3	P38065	1025 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CKB2	P38930	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SLS1	P42900	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	TIM13	P53299	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BUD32	P53323	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PEX29	Q03370	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	HOF1	Q05080	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BOP2	Q06150	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SPT3	P06844	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YER152C	P10356	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
CLF1	YLR117C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SDH3	P33421	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SHP1	P34223	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CSG2	P35206	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YKL162C	P36052	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	VRP1	P37370	817 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SLI15	P38283	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	VPS45	P38932	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	COG3	P40094	801 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PRM2	P40534	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	AGX1	P43567	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ACF4	P47129	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CCC1	P47818	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PKP2	P53170	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YNL181W	P53878	407 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	NMA111	P53920	997 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ERO1	Q03103	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SEN15	Q04675	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	REV1	P12689	985 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	UTR1	P21373	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SYN8	P31377	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	TMT1	P32643	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MSN2	P33748	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	AIM29	P36154	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	HSL7	P38274	827 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YHR054C	P38780	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	HPA3	P39979	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SWM2	P40342	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	CFD1	P40558	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MPS3	P47069	682 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ARH1	P48360	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YGL159W	P53110	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MTQ1	P53944	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SNO1	Q03144	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YDR090C	Q03193	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RTT103	Q05543	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	HDA2	Q06629	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RRT8	Q08219	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	BDS1	Q08347	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FYV7	Q12247	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	FIG2	P25653	1609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	ATP4	P05626	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	URA6	P15700	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	SNF6	P18888	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PUP1	P25043	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	RPD3	P32561	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	PAH1	P32567	862 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLF1	YLR117C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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