RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MTQ1	P53944	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SAM50	P53969	484 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PML39	Q03760	334 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RKM5	Q12367	367 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GIS3	Q12418	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
SKG6	YHR149C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GUT1	P32190	709 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SRY1	P36007	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YKR051W	P36142	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	BET3	P36149	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	UBA4	P38820	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FAD1	P38913	306 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	POP2	P39008	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	VAB2	P40003	282 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SWM2	P40342	146 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	LAS21	P40367	830 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ERR3	P42222	437 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SNG1	P46950	547 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SSY5	P47002	699 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NET1	P47035	1189 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MCM22	P47167	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	REG1	Q00816	1014 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CSM3	Q04659	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GPI11	Q06636	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MRL1	Q06815	381 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RFU1	Q08003	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PNS1	Q12412	539 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PUT4	P15380	627 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MNE1	P24720	663 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GRR1	P24814	1151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CPR4	P25334	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	BUB3	P26449	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MRP4	P32902	394 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MRPL6	P32904	214 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TAT1	P38085	619 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YAR028W	P39548	234 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MGS1	P40151	587 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YJL045W	P47052	634 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	MPS3	P47069	682 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	VPS70	P47161	811 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	DIA3	P52290	468 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PKP2	P53170	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	TIM13	P53299	105 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	UGO1	Q03327	502 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RTN2	Q12443	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CDC7	P06243	507 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ALG7	P07286	448 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	FUN14	P18411	198 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YCL002C	P25565	263 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SNC1	P31109	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YKL069W	P36088	180 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HMT1	P38074	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YBR013C	P38215	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	BIT2	P38346	545 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	AFG3	P39925	761 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NEO1	P40527	1151 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HXT14	P42833	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	CIT3	P43635	486 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	AIM22	P47051	409 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	AAD10	P47182	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HXT16	P47185	567 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	SCW11	P53189	542 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ALG12	P53730	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	ODC1	Q03028	310 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDR090C	Q03193	310 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	NHX1	Q04121	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDR286C	Q05530	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	HFI1	Q12060	488 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SKG6	YHR149C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75

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