RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	BUR6	P40096	142 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SNZ1	Q03148	297 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	HPF1	Q05164	967 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NFT1	P0CE68	1218 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BUB3	P26449	341 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RML2	P32611	393 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	DOA1	P36037	715 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MDM31	P38880	579 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YHR219W	P38900	624 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	TAT2	P38967	592 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	FCY21	P40039	528 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	VRG4	P40107	337 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ZIM17	P42844	174 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	HOC1	P47124	396 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ABZ2	Q03266	374 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	VPS36	Q06696	566 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RCN2	Q12044	265 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YPR022C	Q12139	1133 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	CCH1	P50077	2039 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ARO7	P32178	256 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	OMA1	P36163	345 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PIM1	P36775	1133 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YAL037W	P39728	267 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	CHA4	P43634	648 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	CPR8	P53728	308 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	FIN1	Q03898	291 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SRO7	Q12038	1033 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		7.74	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	COX3	P00420	269 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	GCN3	P14741	305 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NPR1	P22211	790 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	AGP1	P25376	633 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	LYP1	P32487	611 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	OAR1	P35731	278 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YRO2	P38079	344 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PCL6	P40038	420 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NUP57	P48837	541 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	EXG2	P52911	562 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MTQ1	P53944	314 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YMR087W	Q04299	284 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RSF1	Q05043	376 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BRE4	Q07660	1125 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RTT10	Q08924	1013 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BSC1	Q12140	328 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ACF2	Q12168	779 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YOL163W	P0CF20	169 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MGR1	P25573	417 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YHR035W	P38769	630 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ZRG8	P40021	1076 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PEX10	Q05568	337 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	FDH1	Q08911	376 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RAD59	Q12223	238 aa		7.72	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SNF6	P18888	332 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RPB5	P20434	215 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	VPS33	P20795	691 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NDC1	P32500	655 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SFA1	P32771	386 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	EHT1	P38295	451 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MEP3	P53390	489 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BUD17	P53727	317 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RKM5	Q12367	367 aa		7.71	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SLY41	P22215	453 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	YPT7	P32939	208 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	NVJ1	P38881	321 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	CEM1	P39525	442 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	MBP1	P39678	833 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	IRC7	P43623	340 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	CDH1	P53197	566 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	COS1	P53822	381 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	YML096W	Q04489	525 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	VID22	Q05934	901 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	YOL107W	Q12239	342 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	LAG2	Q92325	660 aa		7.71	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	GAL7	P08431	366 aa		7.7	□□□□□ -1.18
GGA2	YHR108W	MET2	P08465	486 aa		7.7	□□□□□ -1.18

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms