RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W MXR2P25566 168 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W CDC12P32468 407 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RPN2P32565 945 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W GDH2P33327 1092 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YAR028WP39548 234 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SPO73P40031 143 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W TPA1P40032 644 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YIL152WP40455 235 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W MRPS18P42847 217 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W AAD14P42884 376 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W PRM8P53174 237 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YGR012WP53206 393 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YPL066WQ12194 479 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YLR126CQ12288 251 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SEC39Q12745 709 aa8.29□□□□□ -1.08
DDI1YER143W KSS1P14681 368 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W THR1P17423 357 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W AAC3P18238 307 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W DBP3P20447 523 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RER1P25560 188 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RPC82P32349 654 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W MSN2P33748 704 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W TDA11P38854 504 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W RCY1P39531 840 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W COG3P40094 801 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W SNM1P40993 198 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W FDH1Q08911 376 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W NFI1Q12216 726 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W YDR061WQ12298 539 aa8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
DDI1YER143W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SIR3P06701 978 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W CBS1P14066 229 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W VPH2P32341 215 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YME2P32843 850 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RPS27BP38711 82 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W BIG1P38813 335 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W ALK1P43633 760 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TIM54P47045 478 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W EMC2P47133 292 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MTQ1P53944 314 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YPL107WQ02873 248 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SMP3Q04174 516 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RNH202Q05635 350 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YLR456WQ06199 204 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W PIN2Q12057 282 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W NKP1Q12493 238 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W HFA1P32874 2273 aa8.27□□□□□ -1.09
DDI1YER143W GAL4P04386 881 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TPK3P05986 398 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RPC40P07703 335 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MRPS28P21771 286 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W URE2P23202 354 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SIC1P38634 284 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TRR2P38816 342 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W PZF1P39933 429 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W FMP52P40008 231 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SPG5P42933 373 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W IMD4P50094 524 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YGR266WP53326 701 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SWP1Q02795 286 aa8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
DDI1YER143W PET9P18239 318 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MCK1P21965 375 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W APN1P22936 367 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W STP22P25604 385 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MKS1P34072 584 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MRPL15P36523 253 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W GOS1P38736 223 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W EGD2P38879 174 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W GID8P40208 455 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RPS12P48589 143 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W ROM1P53046 1155 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TWF1P53250 332 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W COG5P53951 403 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RSN1Q03516 953 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W KRE28Q04431 385 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SMA2Q04658 369 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YEH1Q07804 573 aa8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YCK1P23291 538 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SSE2P32590 693 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W NUF2P33895 451 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TAF14P35189 244 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W LHS1P36016 881 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SPC42P36094 363 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TAT2P38967 592 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MET28P40573 187 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W DUG1P43616 481 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W AAD10P47182 288 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MON1P53129 644 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SCW11P53189 542 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.1 ms