RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RGT1	P32862	1170 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SHP1	P34223	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	LDB7	P38210	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	APD1	P38281	316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	DSE1	P40077	573 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YAR1	P46683	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YDL186W	P48568	277 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	HRD3	Q05787	833 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GMC2	Q06201	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	DAP1	Q12091	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	COX2	P00410	251 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RAD7	P06779	565 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MSK1	P32048	576 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	COS9	P36034	407 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	VPS51	P36116	164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	BIG1	P38813	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SBE22	P38814	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SUR2	P38992	349 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	XBP1	P40489	647 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YGR067C	P53243	804 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YNL181W	P53878	407 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	AAT1	Q01802	451 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	IZH1	Q03419	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	THP1	Q08231	455 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	AAD15	Q08361	143 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SEY1	Q99287	776 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GAL4	P04386	881 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	CHS1	P08004	1131 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	SEC63	P14906	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	CBF1	P17106	351 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	ATP7	P30902	174 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	ACH1	P32316	526 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	UBA4	P38820	440 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	ANS1	P38832	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	DSN1	P40568	576 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	SAD1	P43589	448 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	YGR168C	P53293	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	DIA1	P54005	336 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PLM2	Q04383	521 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	AIM33	Q04516	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	VPS74	Q06385	345 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	TLG2	Q08144	397 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	AFT2	Q08957	416 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	FSH3	Q99369	266 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	STE18	P18852	110 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	DAL82	P21705	255 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	CNA1	P23287	553 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	RRT12	P25381	491 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	DOA1	P36037	715 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	MIA40	P36046	403 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	RSM22	P36056	628 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PFS1	P38872	237 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PCL6	P40038	420 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PHO86	P46956	311 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	SAM50	P53969	484 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	CDD1	Q06549	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	TIP41	Q12199	356 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	RRI1	Q12468	440 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	BI2	P03873	423 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	UTR1	P21373	530 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	CMK2	P22517	447 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	BNA4	P38169	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	HIS2	P38635	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	STP2	P38704	541 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECM1	YAL059W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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