RNA–Protein interactions for RNA: YMR270C

RRN9, Transcript of Protein involved in promoting high level transcription of rDNA, yeast

Gene RRN9, Length 1,098 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN9	YMR270C	OAR1	P35731	278 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	PIG2	P40187	538 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	SPG5	P42933	373 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	NNF2	P53253	936 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	PEX25	Q02969	394 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	VHS1	Q03785	461 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	URH1	Q04179	340 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	BCH1	Q05029	724 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	ATG29	Q12092	213 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	SWT1	Q12104	458 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	GLE1	Q12315	538 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	LAS17	Q12446	633 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	RMD5	Q12508	421 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RRN9	YMR270C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CLB3	P24870	427 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YCR006C	P25350	157 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YCR061W	P25639	631 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CYM1	P32898	989 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MOH1	P38191	138 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	UBA4	P38820	440 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MET28	P40573	187 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	INA22	P40576	216 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	BAP3	P41815	604 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	ELP2	P42935	788 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	NMD5	P46970	1048 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YJR149W	P47177	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	BOL2	P53082	120 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MDM34	P53083	459 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	SLT2	Q00772	484 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	SPE4	Q12455	300 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CSF1	Q12150	2958 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
RRN9	YMR270C	TYR1	P20049	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	URA4	P20051	364 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	AMD2	P22580	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MRPL25	P23369	157 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	EFM1	P38732	585 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YHI9	P38765	294 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YIL086C	P40503	102 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
RRN9	YMR270C	YFL012W	P43580	148 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YJL055W	P47044	245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	HOC1	P47124	396 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	BUL1	P48524	976 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YGR015C	P53208	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CLD1	P53264	445 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MAL13	P53338	473 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YNL058C	P53947	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	TRS23	Q03784	219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YEH1	Q07804	573 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	ENB1	Q08299	606 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	NFI1	Q12216	726 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	ICT1	Q12385	394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CDC8	P00572	216 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	PRP28	P23394	588 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	ADE1	P27616	306 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	SIN4	P32259	974 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MEI5	P32489	222 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	FTH1	P38310	465 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	INM1	P38710	295 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	REV7	P38927	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	GAT1	P43574	510 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	MPS3	P47069	682 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RRN9	YMR270C	YGR066C	P53242	292 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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