RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W VRG4P40107 337 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YJL049WP47048 450 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W FAP1P53971 965 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W SED5Q01590 340 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W SRL4Q03085 281 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W FMP42Q04991 504 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YLR036CQ07986 203 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YPR064WQ12492 139 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W TSC13Q99190 310 aa12.32□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W URE2P23202 354 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W RPS5P26783 225 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W BNA4P38169 460 aa12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W PRE6P40303 254 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W LAS21P40367 830 aa12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W ZIM17P42844 174 aa12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W GCN20P43535 752 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W ROG1P53118 685 aa12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W ARO10Q06408 635 aa12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W TFB4Q12004 338 aa12.31□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W PLB1P39105 664 aa12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W RCY1P39531 840 aa12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W AVT6P40074 448 aa12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W PRM8P53174 237 aa12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W MRX4Q12467 430 aa12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W VCX1Q99385 411 aa12.3□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W GAL7P08431 366 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W DBP3P20447 523 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YIM1P28625 365 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W LHP1P33399 275 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W SRX1P36077 127 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W APT2P36973 181 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W ISC1P40015 477 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W KRE29P40026 464 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W TIF34P40217 347 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YJL068CP40363 299 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W ROM1P53046 1155 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W YOL107WQ12239 342 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W TRM10Q12400 293 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W STT4P37297 1900 aa12.29□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W TCD2P36101 447 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W IPT1P38954 527 aa12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W IRC5P43610 853 aa12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W CWC24P53769 259 aa12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W HER1Q12276 1246 aa12.28□□□□□ -0.44
FPR4YLR449W MF(ALPHA)1P01149 165 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data12.27□□□□□ -0.45not detected
FPR4YLR449W NTH1P32356 751 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W MKK1P32490 508 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ECM4P36156 370 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W TPA1P40032 644 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W COG3P40094 801 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W FAU1P40099 211 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W SNM1P40993 198 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W RBL2P48606 106 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W YGR079WP53249 370 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W MSC1Q03104 513 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W RIM13Q03792 727 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W APC4Q04601 652 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W DIN7Q12086 430 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W YPL066WQ12194 479 aa12.27□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W HTS1P07263 546 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W SLY41P22215 453 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W DOM34P33309 386 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W OAR1P35731 278 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ELO1P39540 310 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W LRO1P40345 661 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W LYS12P40495 371 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W FAA4P47912 694 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W SWS2P53937 143 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W NIS1P53939 407 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ASI1P54074 624 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W RHO4Q00246 291 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W RNH1Q04740 348 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W SWA2Q06677 668 aa12.26□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W SFA1P32771 386 aa12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W CDC13P32797 924 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W NUF2P33895 451 aa12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W FMP46P36141 133 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W APE4P38821 490 aa12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W AIM2P39721 246 aa12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W MON1P53129 644 aa12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W RSC9Q03124 581 aa12.25□□□□□ -0.45
FPR4YLR449W ARP10Q04549 284 aa12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.3 ms