RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	EPT1	P22140	391 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.18	□□□□□ -0.62	not detected
YSC84	YHR016C	PMT1	P33775	817 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	STP2	P38704	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	HEM14	P40012	539 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SER2	P42941	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SCW11	P53189	542 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YDR344C	Q05510	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SIA1	Q12212	622 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	HSP42	Q12329	375 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	MER1	P16523	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	DBF2	P22204	572 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	TRX3	P25372	127 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	ZRT3	P34240	503 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	HXT16	P47185	567 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	DIE2	P50076	525 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	PFA5	Q03289	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SEG1	Q04279	960 aa		11.18	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	TFS1	P14306	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	LOT5	P34234	306 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	CBP4	P37267	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	MIT1	P40002	666 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SER33	P40510	469 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	FET5	P43561	622 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	MRH4	P53166	561 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SWC4	P53201	476 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	MRPL13	Q02204	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	TRM82	Q03774	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	MRX4	Q12467	430 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	CCH1	P50077	2039 aa		11.17	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SIR3	P06701	978 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	CAP2	P13517	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	QDR2	P40474	542 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	TUB4	P53378	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	OAZ1	Q02803	292 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YPL071C	Q02864	156 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YLR446W	Q06204	433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SFM1	Q12314	213 aa		11.16	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	RAM1	P22007	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YIM1	P28625	365 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	IML3	P38265	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YGR201C	P42936	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	HMS2	P47175	358 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	GCV1	P48015	400 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	RTS3	P53289	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	FAP1	P53971	965 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	SWF1	Q04629	336 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	TEN1	Q07921	160 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	YLR036C	Q07986	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	PEX27	Q08580	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	ATG29	Q12092	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
YSC84	YHR016C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	REV1	P12689	985 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-C	P25383	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	NDE1	P40215	560 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PFA3	P42836	336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	VEL1	P53058	206 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MKC7	P53379	596 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TMN2	Q04562	672 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ARG7	Q04728	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	DAP1	Q12091	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-B	Q12260	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	BBP1	Q12365	385 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		11.14	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	OAC1	P32332	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PXA2	P34230	853 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GMH1	P36125	273 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MUM2	P38236	366 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GIC1	P38785	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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