RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SRF1	Q12516	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SRN2	Q99176	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	TSC13	Q99190	310 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PHO5	P00635	467 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ALG7	P07286	448 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HIR2	P32480	875 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GCS1	P35197	352 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YHK8	P38776	514 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RRG9	P40156	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YGR201C	P42936	225 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SER2	P42941	309 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YJL043W	P47053	257 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YJR030C	P47101	745 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YJR098C	P47139	656 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	STE24	P47154	453 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HMS2	P47175	358 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	VPS62	P53285	467 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PFA5	Q03289	374 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MAK3	Q03503	176 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	TRM82	Q03774	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SWA2	Q06677	668 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MRX4	Q12467	430 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SAM35	P14693	329 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RER1	P25560	188 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ARE1	P25628	610 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CTS1	P29029	562 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HXT4	P32467	576 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ISF1	P32488	338 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YKL063C	P35725	167 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PIM1	P36775	1133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PCL5	P38794	229 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	HXT7	P39004	570 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	RCY1	P39531	840 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PAC11	P40960	533 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	FET5	P43561	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YFR018C	P43599	363 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MUP1	P50276	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	MNT2	P53059	558 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	FRE4	P53746	719 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	YSA1	Q01976	231 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	GRX5	Q02784	150 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	FIN1	Q03898	291 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	BSC2	Q05611	235 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SYO1	Q07395	620 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	DIN7	Q12086	430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	ATG29	Q12092	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	SIA1	Q12212	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	NFI1	Q12216	726 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PST1	Q12355	444 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UBX7	YBR273C	PDE2	P06776	526 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	HMG1	P12683	1054 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	EPT1	P22140	391 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PDE1	P22434	369 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	STE5	P32917	917 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PMT1	P33775	817 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SOL2	P37262	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	LDH1	P38139	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MUM2	P38236	366 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	ATG14	P38270	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	YHR033W	P38690	423 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	MDM31	P38880	579 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	AXL2	P38928	823 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	TIM17	P39515	158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SER3	P40054	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	NDE1	P40215	560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	SSU1	P41930	458 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	IRC7	P43623	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBX7	YBR273C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67

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