RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	PEX11	Q12462	236 aa		0.42	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	HEM4	P06174	275 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PET123	P17558	318 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EPT1	P22140	391 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CMK2	P22517	447 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YSR3	P23501	404 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PTC6	P25646	442 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ERG9	P29704	444 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ATS1	P31386	333 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YBR056W	P38081	501 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MAL33	P38157	468 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AVT5	P38176	459 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PSD1	P39006	500 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FLC2	P39719	783 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MEP1	P40260	492 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IMA5	P40884	581 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LCB2	P40970	561 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TOS3	P43637	560 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NCA3	P46955	337 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YJL132W	P47014	750 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RTA1	P53047	317 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RTC4	P53850	401 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL046W	P53956	172 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PET191	Q02772	108 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GIP3	Q03016	1276 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ADD37	Q03233	198 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TRM12	Q04235	462 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PLM2	Q04383	521 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ERV41	Q04651	352 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TAF9	Q05027	157 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GRE1	Q08969	168 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ATO3	Q12359	275 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ARP7	Q12406	477 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	POM34	Q12445	299 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ZPS1	Q12512	249 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UGA1	P17649	471 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PBN1	P25580	416 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HXT1	P32465	570 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	KAR9	P32526	644 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UTR5	P32630	166 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPC34	P32910	317 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YHR045W	P38775	560 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	APE4	P38821	490 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CYC2	P38909	366 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
AI1	Q0050	YEL073C	P39974	107 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YIL077C	P40508	320 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GAT4	P40569	121 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CIN1	P40987	1014 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	IRC6	P43615	237 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SNG1	P46950	547 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MND1	P53102	219 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	BOR1	P53838	576 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	FMN1	Q03778	218 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TAZ1	Q06510	381 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	MHR1	Q06630	226 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CYK3	Q07533	885 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YOL075C	Q08234	1294 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	RAD10	P06838	210 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	CBS1	P14066	229 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	VBA3	P25594	458 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	HEM3	P28789	327 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	NDI1	P32340	513 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YBR144C	P34215	104 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	YKL187C	P34231	750 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	TPO5	P36029	618 aa		0.4	□□□□□ -2.34
AI1	Q0050	APD1	P38281	316 aa		0.4	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40 ms