RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTAGE1Q96RT6 745 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCND1Q9NSA2 647 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR13Q9NZ81 148 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF804BA4D1E1 1349 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 LPXNO60711 386 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP2B4P23634 1241 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAN2A2P49641 1150 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 RABGGTBP53611 331 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP12-2P59991 146 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1QL3Q5VWW1 255 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTBK2Q6IQ55 1244 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF788Q6ZQV5 615 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTR3DQ70Z44 454 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLITRK4Q8IW52 837 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 CARD11Q9BXL7 1154 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERHL2Q9H4I8 314 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP4R2Q9NY27 417 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 DTLQ9NZJ0 730 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 REV1Q9UBZ9 1251 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL3Q9UH77 587 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 NR2E1Q9Y466 385 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP0.72□□□□□ -2.29
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 MGST3O14880 152 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGAP6O43182 974 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 PROP1O75360 226 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D8O95759 1140 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 GBP1P32455 592 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADCY1Q08828 1119 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETFDHQ16134 617 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF568Q3ZCX4 644 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 GFI1BQ5VTD9 330 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARRDC4Q8NCT1 418 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUPT20HQ8NEM7 779 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC14L1Q92503 715 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHOVQ96L33 236 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 COQ10AQ96MF6 247 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 AP5M1Q9H0R1 490 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 NELFAQ9H3P2 528 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 EBF3Q9H4W6 596 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSPBP1Q9NZL4 362 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASH2LQ9UBL3 628 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TLK1Q9UKI8 766 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTT1P30711 240 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP14P54578 494 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS26P62854 115 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 HGFACQ04756 655 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF662Q6ZS27 426 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 C18orf65Q6ZTR6 163 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 MILR1Q7Z6M3 343 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM176AQ96HP8 235 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR11Q9BZH6 1224 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF10CO14798 259 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 WNT9AO14904 365 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBC1D4O60343 1298 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL18BPO95998 194 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUCA1P04066 466 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCAMP43121 646 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 THBS3P49746 956 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 RRADP55042 308 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD35Q8N283 1001 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPF3Q92784 378 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPHOSPH9Q99550 1183 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCMBPQ9BTE3 642 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 DKK2Q9UBU2 259 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 HTR3BO95264 441 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITPKBP27987 946 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TROAPQ12815 778 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZMAT1Q5H9K5 638 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF626Q68DY1 528 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 RCSD1Q6JBY9 416 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGMOQ6ZNB7 445 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGEF25Q86VW2 580 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 MIEF2Q96C03 454 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRMOQ9BU70 441 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR87Q9BY21 358 aa0.68□□□□□ -2.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 NIF3L1Q9GZT8 377 aa0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms