Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.11□□□□□ -1.272e-16■■■■■ 10128.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC11.53□□□□□ -0.569e-124■■■■■ 2018.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP79-201ENST00000363373 336 ntBASIC9.39□□□□□ -0.912e-17■■■■■ 1942.1
LARP7Q4G0J3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 1366.2
LARP7Q4G0J3 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-180■■■■■ 1014.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC9□□□□□ -0.973e-125■■■■■ 989.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.72□□□□□ -1.332e-54■■■■■ 910.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.372e-43■■■■■ 873.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.632e-82■■■■■ 800.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC9.3□□□□□ -0.922e-46■■■■■ 789.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC12.72□□□□□ -0.378e-9■■■■■ 787.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP193-201ENST00000364488 306 ntBASIC11.06□□□□□ -0.648e-72■■■■■ 771.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.344e-119■■■■■ 761.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP163-201ENST00000363221 330 ntBASIC9.28□□□□□ -0.922e-75■■■■■ 694.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP176-201ENST00000363673 318 ntBASIC11.24□□□□□ -0.619e-180■■■■■ 677.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC12.42□□□□□ -0.422e-29■■■■■ 655.1
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-209ENST00000467966 627 ntTSL 313.32□□□□□ -0.283e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.63e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 AC097382.1-201ENST00000441093 591 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.853e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.493e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-39■■■■■ 611.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP80-201ENST00000365188 283 ntBASIC9.87□□□□□ -0.831e-39■■■■■ 611.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.18□□□□□ -0.144e-80■■■■■ 608.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC12.72□□□□□ -0.371e-37■■■■■ 577.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP249-201ENST00000365490 355 ntBASIC9.26□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 550.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP290-201ENST00000606842 195 ntBASIC8.97□□□□□ -0.977e-63■■■■■ 546.9
LARP7Q4G0J3 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 58.77□□□□□ -1.016e-31■■■■■ 542.8
LARP7Q4G0J3 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.46e-31■■■■■ 542.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.374e-22■■■■■ 437.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.06□□□□□ -0.163e-28■■■■■ 406.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC12.16□□□□□ -0.463e-38■■■■■ 387
LARP7Q4G0J3 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.935e-31■■■■■ 385.3
LARP7Q4G0J3 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.985e-31■■■■■ 385.3
LARP7Q4G0J3 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-31■■■■■ 385.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC8.24□□□□□ -1.096e-15■■■■■ 350.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP45-201ENST00000363509 304 ntBASIC9.08□□□□□ -0.966e-30■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-203ENST00000589659 886 ntTSL 317.46■□□□□ 0.399e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.279e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.219e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-205ENST00000590465 1998 ntTSL 213.21□□□□□ -0.299e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.379e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP22-201ENST00000365097 293 ntBASIC8.78□□□□□ -19e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-206ENST00000592232 1030 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.399e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.41□□□□□ -0.264e-95■■■■■ 329.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt10.67□□□□□ -0.74e-95■■■■■ 329.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt10.51□□□□□ -0.734e-95■■■■■ 329.3
LARP7Q4G0J3 UBAC2-204ENST00000457666 627 ntTSL 317.59■□□□□ 0.414e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 316.61■□□□□ 0.254e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-206ENST00000468067 968 ntTSL 211.55□□□□□ -0.564e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP9-201ENST00000364923 299 ntBASIC11.22□□□□□ -0.614e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-207ENST00000473091 610 ntTSL 410.42□□□□□ -0.744e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.343e-39■■■■■ 290.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.78□□□□□ -1.325e-79■■■■■ 280.9
LARP7Q4G0J3 KIF24-202ENST00000402558 6131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-36■■■■■ 275.2
LARP7Q4G0J3 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.794e-36■■■■■ 275.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC7.79□□□□□ -1.162e-26■■■■■ 274.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-204ENST00000525558 439 ntTSL 48.13□□□□□ -1.112e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-202ENST00000524649 489 ntTSL 36.95□□□□□ -1.32e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-205ENST00000529406 449 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-208ENST00000534060 501 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.632e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.72e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.712e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.353e-154■■■■■ 270.2
LARP7Q4G0J3 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 317.55■□□□□ 0.44e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 417.55■□□□□ 0.44e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 415.41■□□□□ 0.064e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.114e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.17□□□□□ -1.264e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 34.52□□□□□ -1.694e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP291-201ENST00000362961 327 ntBASIC9.36□□□□□ -0.911e-73■■■■■ 230.2
LARP7Q4G0J3 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 59.03□□□□□ -0.966e-51■■■■■ 227.8
LARP7Q4G0J3 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.856e-51■■■■■ 227.8
LARP7Q4G0J3 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC9.65□□□□□ -0.861e-14■■■■■ 222.3
LARP7Q4G0J3 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-45■■■■■ 221.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.954e-45■■■■■ 221.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP94-201ENST00000411044 284 ntBASIC8.83□□□□□ -11e-34■■■■■ 220.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.58e-30■■■■■ 209.9
LARP7Q4G0J3 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.433e-14■■■■■ 202.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.546e-29■■■■■ 193.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP243-201ENST00000363105 309 ntBASIC9.58□□□□□ -0.888e-28■■■■■ 189.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.57□□□□□ -1.363e-49■■■■■ 182.5
LARP7Q4G0J3 KCTD19-210ENST00000569333 4913 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-203ENST00000562721 702 ntTSL 312.79□□□□□ -0.361e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-209ENST00000568736 575 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-206ENST00000566295 423 ntTSL 510.77□□□□□ -0.691e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-202ENST00000561625 570 ntTSL 410.52□□□□□ -0.731e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-207ENST00000566392 4186 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-211ENST00000570049 4754 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-201ENST00000304372 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-208ENST00000567976 528 ntTSL 47.77□□□□□ -1.171e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.331e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-208ENST00000579988 910 ntTSL 317.04■□□□□ 0.323e-64■■■■■ 178.9
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