Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.11□□□□□ -1.272e-16■■■■■ 10128.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC11.53□□□□□ -0.569e-124■■■■■ 2018.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP79-201ENST00000363373 336 ntBASIC9.39□□□□□ -0.912e-17■■■■■ 1942.1
LARP7Q4G0J3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 1366.2
LARP7Q4G0J3 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-180■■■■■ 1014.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC9□□□□□ -0.973e-125■■■■■ 989.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.72□□□□□ -1.332e-54■■■■■ 910.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.372e-43■■■■■ 873.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.632e-82■■■■■ 800.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC9.3□□□□□ -0.922e-46■■■■■ 789.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC12.72□□□□□ -0.378e-9■■■■■ 787.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP193-201ENST00000364488 306 ntBASIC11.06□□□□□ -0.648e-72■■■■■ 771.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.344e-119■■■■■ 761.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP163-201ENST00000363221 330 ntBASIC9.28□□□□□ -0.922e-75■■■■■ 694.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP176-201ENST00000363673 318 ntBASIC11.24□□□□□ -0.619e-180■■■■■ 677.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC12.42□□□□□ -0.422e-29■■■■■ 655.1
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-209ENST00000467966 627 ntTSL 313.32□□□□□ -0.283e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.63e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 AC097382.1-201ENST00000441093 591 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.853e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.493e-30■■■■■ 637.9
LARP7Q4G0J3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-39■■■■■ 611.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP80-201ENST00000365188 283 ntBASIC9.87□□□□□ -0.831e-39■■■■■ 611.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.18□□□□□ -0.144e-80■■■■■ 608.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC12.72□□□□□ -0.371e-37■■■■■ 577.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP249-201ENST00000365490 355 ntBASIC9.26□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 550.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP290-201ENST00000606842 195 ntBASIC8.97□□□□□ -0.977e-63■■■■■ 546.9
LARP7Q4G0J3 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 58.77□□□□□ -1.016e-31■■■■■ 542.8
LARP7Q4G0J3 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.46e-31■■■■■ 542.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.374e-22■■■■■ 437.5
LARP7Q4G0J3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.06□□□□□ -0.163e-28■■■■■ 406.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC12.16□□□□□ -0.463e-38■■■■■ 387
LARP7Q4G0J3 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.935e-31■■■■■ 385.3
LARP7Q4G0J3 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.985e-31■■■■■ 385.3
LARP7Q4G0J3 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-31■■■■■ 385.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP37-201ENST00000364494 296 ntBASIC8.24□□□□□ -1.096e-15■■■■■ 350.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP45-201ENST00000363509 304 ntBASIC9.08□□□□□ -0.966e-30■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-203ENST00000589659 886 ntTSL 317.46■□□□□ 0.399e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.279e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.219e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-205ENST00000590465 1998 ntTSL 213.21□□□□□ -0.299e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.379e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP22-201ENST00000365097 293 ntBASIC8.78□□□□□ -19e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SLC7A9-206ENST00000592232 1030 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.399e-17■■■■■ 344.7
LARP7Q4G0J3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.41□□□□□ -0.264e-95■■■■■ 329.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt10.67□□□□□ -0.74e-95■■■■■ 329.3
LARP7Q4G0J3 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt10.51□□□□□ -0.734e-95■■■■■ 329.3
LARP7Q4G0J3 UBAC2-204ENST00000457666 627 ntTSL 317.59■□□□□ 0.414e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-201ENST00000355700 748 ntTSL 316.61■□□□□ 0.254e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-206ENST00000468067 968 ntTSL 211.55□□□□□ -0.564e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP9-201ENST00000364923 299 ntBASIC11.22□□□□□ -0.614e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 UBAC2-207ENST00000473091 610 ntTSL 410.42□□□□□ -0.744e-13■■■■■ 291.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.343e-39■■■■■ 290.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC6.78□□□□□ -1.325e-79■■■■■ 280.9
LARP7Q4G0J3 KIF24-202ENST00000402558 6131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.664e-36■■■■■ 275.2
LARP7Q4G0J3 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.794e-36■■■■■ 275.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP119-201ENST00000410753 273 ntBASIC7.79□□□□□ -1.162e-26■■■■■ 274.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-204ENST00000525558 439 ntTSL 48.13□□□□□ -1.112e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-202ENST00000524649 489 ntTSL 36.95□□□□□ -1.32e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-205ENST00000529406 449 ntTSL 36.3□□□□□ -1.42e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-208ENST00000534060 501 ntTSL 34.95□□□□□ -1.622e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.632e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.72e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.712e-22■■■■■ 272.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.353e-154■■■■■ 270.2
LARP7Q4G0J3 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 317.55■□□□□ 0.44e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 417.55■□□□□ 0.44e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 415.41■□□□□ 0.064e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.114e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.17□□□□□ -1.264e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 34.52□□□□□ -1.694e-25■■■■■ 255.7
LARP7Q4G0J3 RN7SKP291-201ENST00000362961 327 ntBASIC9.36□□□□□ -0.911e-73■■■■■ 230.2
LARP7Q4G0J3 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 59.03□□□□□ -0.966e-51■■■■■ 227.8
LARP7Q4G0J3 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.856e-51■■■■■ 227.8
LARP7Q4G0J3 U3.38-201ENST00000408534 216 ntBASIC9.65□□□□□ -0.861e-14■■■■■ 222.3
LARP7Q4G0J3 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.124e-45■■■■■ 221.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.954e-45■■■■■ 221.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP94-201ENST00000411044 284 ntBASIC8.83□□□□□ -11e-34■■■■■ 220.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.58e-30■■■■■ 209.9
LARP7Q4G0J3 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.433e-14■■■■■ 202.2
LARP7Q4G0J3 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.45□□□□□ -1.546e-29■■■■■ 193.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP243-201ENST00000363105 309 ntBASIC9.58□□□□□ -0.888e-28■■■■■ 189.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.57□□□□□ -1.363e-49■■■■■ 182.5
LARP7Q4G0J3 KCTD19-210ENST00000569333 4913 ntTSL 212.94□□□□□ -0.341e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-203ENST00000562721 702 ntTSL 312.79□□□□□ -0.361e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-209ENST00000568736 575 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-206ENST00000566295 423 ntTSL 510.77□□□□□ -0.691e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-202ENST00000561625 570 ntTSL 410.52□□□□□ -0.731e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-207ENST00000566392 4186 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-211ENST00000570049 4754 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-201ENST00000304372 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 KCTD19-208ENST00000567976 528 ntTSL 47.77□□□□□ -1.171e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.77□□□□□ -1.331e-31■■■■■ 181.8
LARP7Q4G0J3 SLC39A11-208ENST00000579988 910 ntTSL 317.04■□□□□ 0.323e-64■■■■■ 178.9
Retrieved 100 of 2,094 protein–RNA pairs in 45.9 ms