Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX7

PLEKHG4, Puratrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4Q58EX7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLEKHG4Q58EX7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PLEKHG4Q58EX7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PLEKHG4Q58EX7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PLEKHG4Q58EX7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PLEKHG4Q58EX7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PLEKHG4Q58EX7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PLEKHG4Q58EX7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PLEKHG4Q58EX7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLEKHG4Q58EX7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PLEKHG4Q58EX7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PLEKHG4Q58EX7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PLEKHG4Q58EX7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PLEKHG4Q58EX7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
PLEKHG4Q58EX7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PLEKHG4Q58EX7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PLEKHG4Q58EX7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLEKHG4Q58EX7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PLEKHG4Q58EX7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PLEKHG4Q58EX7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PLEKHG4Q58EX7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PLEKHG4Q58EX7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PLEKHG4Q58EX7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PLEKHG4Q58EX7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PLEKHG4Q58EX7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PLEKHG4Q58EX7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLEKHG4Q58EX7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PLEKHG4Q58EX7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PLEKHG4Q58EX7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PLEKHG4Q58EX7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PLEKHG4Q58EX7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PLEKHG4Q58EX7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PLEKHG4Q58EX7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PLEKHG4Q58EX7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PLEKHG4Q58EX7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
PLEKHG4Q58EX7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLEKHG4Q58EX7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PLEKHG4Q58EX7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLEKHG4Q58EX7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PLEKHG4Q58EX7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLEKHG4Q58EX7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLEKHG4Q58EX7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLEKHG4Q58EX7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLEKHG4Q58EX7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PLEKHG4Q58EX7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PLEKHG4Q58EX7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PLEKHG4Q58EX7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PLEKHG4Q58EX7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PLEKHG4Q58EX7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PLEKHG4Q58EX7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PLEKHG4Q58EX7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PLEKHG4Q58EX7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PLEKHG4Q58EX7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PLEKHG4Q58EX7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PLEKHG4Q58EX7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PLEKHG4Q58EX7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PLEKHG4Q58EX7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PLEKHG4Q58EX7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PLEKHG4Q58EX7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLEKHG4Q58EX7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLEKHG4Q58EX7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PLEKHG4Q58EX7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PLEKHG4Q58EX7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PLEKHG4Q58EX7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PLEKHG4Q58EX7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PLEKHG4Q58EX7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PLEKHG4Q58EX7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PLEKHG4Q58EX7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PLEKHG4Q58EX7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLEKHG4Q58EX7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLEKHG4Q58EX7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLEKHG4Q58EX7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PLEKHG4Q58EX7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PLEKHG4Q58EX7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PLEKHG4Q58EX7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PLEKHG4Q58EX7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PLEKHG4Q58EX7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PLEKHG4Q58EX7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PLEKHG4Q58EX7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PLEKHG4Q58EX7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PLEKHG4Q58EX7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PLEKHG4Q58EX7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PLEKHG4Q58EX7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PLEKHG4Q58EX7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PLEKHG4Q58EX7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PLEKHG4Q58EX7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PLEKHG4Q58EX7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PLEKHG4Q58EX7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PLEKHG4Q58EX7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PLEKHG4Q58EX7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PLEKHG4Q58EX7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PLEKHG4Q58EX7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PLEKHG4Q58EX7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PLEKHG4Q58EX7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms