RNA–Protein interactions for RNA: YNL337W

YNL337W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL337W, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL337W	YNL337W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	SDH4	P37298	181 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	SIP4	P46954	829 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	AZR1	P50080	613 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	FAR10	Q06001	478 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	POL4	P25615	582 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	ATG12	P38316	186 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	SBE22	P38814	852 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	CCT6	P39079	546 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	RGM1	Q00453	211 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	NBP2	Q12163	236 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	ALG5	P40350	334 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	ZRG17	P53735	605 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	PEP3	P27801	918 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	PFS1	P38872	237 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	YER010C	P40011	234 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	YIL029C	P40538	142 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	MST27	P53176	234 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	MFG1	Q07684	458 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	PLB3	Q08108	686 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL337W	YNL337W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	COQ5	P49017	307 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	YDR387C	Q04162	555 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	THI2	P38141	450 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	MUM2	P38236	366 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	BCH1	Q05029	724 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	RLM1	Q12224	676 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	ORT1	Q12375	292 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	SNF6	P18888	332 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	AXL2	P38928	823 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	0.19	□□□□□ -2.38	not detected
YNL337W	YNL337W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	ATP10	P18496	279 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	ECM27	P47144	725 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	YSA1	Q01976	231 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	MIX17	Q03667	156 aa		0.18	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	VHS2	P40463	436 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	RMD5	Q12508	421 aa		0.17	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	COS4	P43542	379 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	PET130	P47065	347 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	MRM2	P53123	320 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	DSL1	P53847	754 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	CEX1	Q12453	761 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	YOL085C	Q99345	113 aa		0.16	□□□□□ -2.38
YNL337W	YNL337W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	PRE8	P23639	250 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YIL059C	P40520	121 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	DOS2	P54858	310 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	NYV1	Q12255	253 aa		0.15	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	DAL5	P15365	543 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	TRR2	P38816	342 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YGL108C	P53139	140 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	BET5	Q03630	159 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SGT1	Q08446	395 aa		0.14	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	PRD1	P25375	712 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	PHA2	P32452	334 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YEF1	P32622	495 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.13	□□□□□ -2.39	not detected
YNL337W	YNL337W	VID30	P53076	958 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YPT6	Q99260	215 aa		0.13	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	DEP1	P31385	405 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SIN4	P32259	974 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	LCB3	P47013	409 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YJR008W	P47085	338 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	YLR278C	Q05854	1341 aa		0.12	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	PDC2	P32896	925 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	FRM2	P37261	193 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	HAC1	P41546	238 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	SFH5	P47008	294 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	HMS2	P47175	358 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	VHT1	P53241	593 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	HSP31	Q04432	237 aa		0.11	□□□□□ -2.39
YNL337W	YNL337W	AVL9	Q12500	764 aa		0.11	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41 ms