RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LBX2Q6XYB7 198 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 LIPIQ6XZB0 460 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 BRAPQ7Z569 592 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NETO2Q8NC67 525 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 DPF3Q92784 378 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SCLYQ96I15 445 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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TRDN-204ENST00000542443 SLC9A5Q14940 896 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NIM1KQ8IY84 436 aa7.1□□□□□ -1.27
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TRDN-204ENST00000542443 USP40Q9NVE5 1235 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.1□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 MYO1BO43795 1136 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 NTRK1P04629 796 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRDN-204ENST00000542443 HTRA3P83110 453 aa7.09□□□□□ -1.27
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TRDN-204ENST00000542443 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 MFSD3Q96ES6 412 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 BDH2Q9BUT1 245 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 BTG4Q9NY30 223 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.09□□□□□ -1.27
TRDN-204ENST00000542443 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 CRTAMO95727 393 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 NAT1P18440 290 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 GTF2A2P52657 109 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRDN-204ENST00000542443 PLP2Q04941 152 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 LSAMPQ13449 338 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 Q8N1Y9 231 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 NOX5Q96PH1 765 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 CDIP1Q9H305 208 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 TMX1Q9H3N1 280 aa7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRDN-204ENST00000542443 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.08□□□□□ -1.28
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TRDN-204ENST00000542443 RTP5Q14D33 572 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 KIZQ2M2Z5 673 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 NLRP10Q86W26 655 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.07□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 SH3D21A4FU49 640 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 MASP1P48740 699 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 UBXN11Q5T124 520 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 FERMT3Q86UX7 667 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 CARFQ8N187 725 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.06□□□□□ -1.28
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TRDN-204ENST00000542443 A0A087X0B3 334 aa7.05□□□□□ -1.28
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TRDN-204ENST00000542443 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 CEP68Q76N32 757 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.05□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD62A6NC57 917 aa7.04□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 FAM83GA6ND36 823 aa7.04□□□□□ -1.28
TRDN-204ENST00000542443 FPR2P25090 351 aa7.04□□□□□ -1.28
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