RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RSA1	Q08932	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	HEM15	P16622	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YIL067C	P40514	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SPC19	Q03954	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	MUM3	Q08750	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	REC107	P21651	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YOX1	P34161	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YBR139W	P38109	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YPI1	P43587	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	ECM27	P47144	725 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	IBD2	P53892	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SEC63	P14906	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YHR054C	P38780	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SAS2	P40963	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SSU1	P41930	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SSN8	P47821	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	GOR1	P53839	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	VAM3	Q12241	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	BEM1	P29366	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SIN4	P32259	974 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YME2	P32843	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SPG5	P42933	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YGL138C	P53122	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	ESA1	Q08649	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	SNT1	P25357	1226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YCR051W	P25631	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	KRE2	P27809	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	MIX23	P38162	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	MST28	P39552	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	LAM5	P43560	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	COS5	P47187	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	COS7	Q07788	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	YOR387C	Q08910	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	HSP42	Q12329	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	ISN1	Q99312	450 aa		4.59	□□□□□ -1.67
snR34	snR34	STB6	P36085	766 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	SDS24	P38314	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RFC3	P38629	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	NDT80	P38830	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	KAP120	Q02932	1032 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RRN11	Q04712	507 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	ROY1	Q04847	553 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	PBA1	Q05778	276 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	MDM30	Q05930	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	TIM18	Q08749	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	CPR4	P25334	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RHB1	P25378	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	HIR2	P32480	875 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	YBL059W	P34224	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	FRE4	P53746	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	ERV2	Q12284	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	AFI1	Q99222	893 aa		4.57	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	PIM1	P36775	1133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RIB5	P38145	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
snR34	snR34	YGL242C	P53066	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	SKO1	Q02100	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	DON1	Q05610	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	SGT1	Q08446	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	YLR108C	Q12259	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RAD61	Q99359	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	SPS22	P25380	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RPC53	P25441	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	ADK2	P26364	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	NAM9	P27929	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	ITR1	P30605	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	NCA3	P46955	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	HMS2	P47175	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	YNR048W	P53740	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	REX4	Q08237	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	PDX1	P16451	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
snR34	snR34	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	TOF1	P53840	1238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
snR34	snR34	SOR2	Q07786	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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