RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	RAD9	P14737	1309 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ZRC1	P20107	442 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ELO2	P25358	347 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PBN1	P25580	416 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	DEP1	P31385	405 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	STE14	P32584	239 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SAF1	P38352	637 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YMR262W	P38430	313 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	GPI16	P38875	610 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YHR210C	P38893	341 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ELO1	P39540	310 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	DSN1	P40568	576 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	HIT1	P46973	164 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	FMP33	P46998	180 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	FHN1	P53279	174 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	IVY1	Q04934	453 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	CYK3	Q07533	885 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	RAX1	Q08760	435 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	BAG7	Q12128	409 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PTC6	P25646	442 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	DUG2	P38149	878 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PCL6	P40038	420 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YGL108C	P53139	140 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.26	□□□□□ -1.89	not detected
TOP1	YOL006C	SAM50	P53969	484 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	GRS2	Q06817	618 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	POS5	Q06892	414 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SHS1	Q07657	551 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PEX27	Q08580	376 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ATG9	Q12142	997 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	COX3	P00420	269 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	AAC1	P04710	309 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YAK1	P14680	807 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	KRE2	P27809	442 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	CIN8	P27895	1000 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ICS2	P38284	255 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SPG5	P42933	373 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PTR3	P43606	678 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YAR1	P46683	200 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	MIG2	P53035	382 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SHR3	Q02774	210 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PAM18	Q07914	168 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	COX1	P00401	534 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	COX2	P00410	251 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ABF1	P14164	731 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SEC63	P14906	663 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	UTR1	P21373	530 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YSR3	P23501	404 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	CDC20	P26309	610 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ATP7	P30902	174 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	BCS1	P32839	456 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	RTC2	P38279	296 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	VHC1	P38329	1120 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SBE22	P38814	852 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YHR122W	P38829	231 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SPC97	P38863	823 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	HXT9	P40885	567 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SAD1	P43589	448 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	ATG27	P46989	271 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	TAX4	P47030	604 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	STE24	P47154	453 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	MSY1	P48527	492 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	MTL1	P53214	551 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YNL181W	P53878	407 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	DIA1	P54005	336 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	HXT11	P54862	567 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SPP2	Q02521	185 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	NRG1	Q03125	231 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	PLB2	Q03674	706 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	VPS74	Q06385	345 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	SYO1	Q07395	620 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TOP1	YOL006C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.25	□□□□□ -1.89	not detected

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