RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeastyeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4YOL003C OPY1P38271 328 aa4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C IRC15Q02733 499 aa4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C TAF11Q04226 346 aa4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C RQC1Q05468 723 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C VPS74Q06385 345 aa4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C RIM20Q12033 661 aa4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C AYT1Q12226 474 aa4.53□□□□□ -1.68
PFA4YOL003C MET17P06106 444 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C EXO70P19658 623 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C IME2P32581 645 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C MFT1P33441 392 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C PMT1P33775 817 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C MTC4P38335 694 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C SMF1P38925 575 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C MDM1Q01846 1127 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C SET6Q12529 373 aa4.52□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C HAT2P39984 401 aa4.51□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C YJL213WP40896 331 aa4.51□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C HXT14P42833 540 aa4.51□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C YGL108CP53139 140 aa4.51□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C SLM3Q12093 417 aa4.51□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RKM5Q12367 367 aa4.51□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C CYB2P00175 591 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C MES1P00958 751 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C ATR1P13090 542 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C MCK1P21965 375 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C SHO1P40073 367 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C FAU1P40099 211 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C SYG1P40528 902 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C VMA13P41807 478 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C URB2P47108 1174 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C CSI1Q04368 295 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RRD2Q12461 358 aa4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C GDH1P07262 454 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C BUB3P26449 341 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C ERG3P32353 365 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C NPL6P32832 435 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RGT1P32862 1170 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C PMU1P36069 295 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C KRE9P39005 276 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C ALG8P40351 577 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C GWT1P47026 490 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C SRB7P47822 140 aa4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C INH1P01097 85 aa4.48□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C HEM2P05373 342 aa4.48□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C IMP4P53941 290 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RTN2Q12443 393 aa4.48□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RHO2P06781 192 aa4.47□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RED1P14291 827 aa4.47□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C CLC1P17891 233 aa4.47□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RNA14P25298 677 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C RAD14P28519 371 aa4.47□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C ELP2P42935 788 aa4.47□□□□□ -1.69
PFA4YOL003C YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data4.47□□□□□ -1.69not detected
PFA4YOL003C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C SPB1P25582 841 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C AGA1P32323 725 aa4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C OTU2P38747 307 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C POP1P41812 875 aa4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C ARK1P53974 638 aa4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C NKP2Q06162 153 aa4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C SCM3Q12334 223 aa4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C CTF3Q12748 733 aa4.46□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C ATP10P18496 279 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C GYP6P32806 458 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C TUL1P36096 758 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C TIF5P38431 405 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YHR218WP38899 603 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C IDP2P41939 412 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YGR149WP48236 432 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C SOV1Q04748 898 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YLR287CQ05881 355 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C ALE1Q08548 619 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YOL159C-AQ3E769 90 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C RAD50P12753 1312 aa4.45□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C CPR3P25719 182 aa4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C AFG1P32317 509 aa4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C HXT3P32466 567 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C THI2P38141 450 aa4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C GCD10P41814 478 aa4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C VTA1Q06263 330 aa4.44□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YRF1-3P0CX14 1859 aa4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YRF1-7P0CX15 1859 aa4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C YRF1-6P53819 1859 aa4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C LYS2P07702 1392 aa4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C RSF2P46974 1380 aa4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C LEU4P06208 619 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C LPD1P09624 499 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C SPS4P09937 338 aa4.43□□□□□ -1.7
PFA4YOL003C JNM1P36224 373 aa4.43□□□□□ -1.7
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