RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	AVT5	P38176	459 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YHR054C	P38780	354 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YFL067W	P43537	175 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	ECM27	P47144	725 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	IBD2	P53892	351 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	HSP42	Q12329	375 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	HEM15	P16622	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YME2	P32843	850 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	NAT2	P37293	288 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	COS5	P47187	383 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YGL138C	P53122	345 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	COS7	Q07788	383 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPC24	YMR117C	YCR051W	P25631	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	KRE2	P27809	442 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	VAM3	Q12241	283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SIN4	P32259	974 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	PIM1	P36775	1133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SAS2	P40963	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YPI1	P43587	155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RRN11	Q04712	507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	DON1	Q05610	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	CHS1	P08004	1131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SEC63	P14906	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SNT1	P25357	1226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	BEM1	P29366	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SKO1	Q02100	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	ROY1	Q04847	553 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SGT1	Q08446	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	ESA1	Q08649	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RSA1	Q08932	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SPS22	P25380	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	STB6	P36085	766 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RFC3	P38629	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	MST28	P39552	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	LAM5	P43560	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YGL242C	P53066	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	REX4	Q08237	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	TIM18	Q08749	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	AFI1	Q99222	893 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	PDX1	P16451	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RHB1	P25378	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RPC53	P25441	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	HIR2	P32480	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	MIX23	P38162	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YIL067C	P40514	678 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	ISN1	Q99312	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	ADK2	P26364	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YBL059W	P34224	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YBR139W	P38109	508 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	MMS4	P38257	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SPC24	YMR117C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	YNR048W	P53740	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	FRE4	P53746	719 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	GOR1	P53839	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SPC24	YMR117C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	PBA1	Q05778	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	MDM30	Q05930	598 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RAD61	Q99359	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	TFB1	P32776	642 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	RIB5	P38145	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	NDT80	P38830	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SPG5	P42933	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	HMS2	P47175	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SPC24	YMR117C	SCEI	P03882	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	URA4	P20051	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	CPR4	P25334	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
SPC24	YMR117C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YMR181C	Q03231	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	RMT2	Q03305	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	ERV2	Q12284	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SPC24	YMR117C	LSB5	P25369	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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