RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	YJL045W	P47052	634 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ABM1	P47146	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	VPS62	P53285	467 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YNR068C	P53754	272 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HXT11	P54862	567 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SPR6	Q01684	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NUP49	Q02199	472 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PRM15	Q03262	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MDM30	Q05930	598 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RAD34	Q06665	692 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IRC3	Q06683	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ASR1	Q06834	288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TPO1	Q07824	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YRR1	Q12172	810 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NYV1	Q12255	253 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MYO1	P08964	1928 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RIF1	P29539	1916 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MOT1	P32333	1867 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HIS5	P07172	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YIM1	P28625	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SRB6	P32570	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	NVJ1	P38881	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ACO2	P39533	789 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SAW1	P39735	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YER010C	P40011	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	VRG4	P40107	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SLM1	P40485	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AAD14	P42884	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ALY2	P47029	1046 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	HLJ1	P48353	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YGR168C	P53293	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RRN5	Q02983	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	IRC4	Q03036	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RUB1	Q03919	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PPN1	Q04119	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PEX12	Q04370	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	BCH1	Q05029	724 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AI4	P03878	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	AAC1	P04710	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RHO2	P06781	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	MAS2	P11914	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
CLF1	YLR117C	MRPL44	P19956	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	BEM1	P29366	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	ERG9	P29704	444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PHA2	P32452	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PDC2	P32896	925 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	KAE1	P36132	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	UBX7	P38349	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	COS8	P38723	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PTC7	P38797	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YHR182W	P38870	785 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RBG1	P39729	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	RTA1	P53047	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DMA2	P53924	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TRM12	Q04235	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	CSM3	Q04659	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	SCP1	Q08873	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	PCC1	Q3E833	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CLF1	YLR117C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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