RNA–Protein interactions for RNA: YKL177W

YKL177W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL177W, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL177W	YKL177W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	COX3	P00420	269 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MDM10	P18409	493 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	EXO70	P19658	623 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	SEC62	P21825	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MGR1	P25573	417 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ACH1	P32316	526 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YEL043W	P32618	956 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	FRE1	P32791	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ECM15	P35195	104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MIC60	P36112	540 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	CHS6	P40955	746 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	TRS85	P46944	698 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MDE1	P47095	244 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PIB2	P53191	635 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	BET4	Q00618	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	BNA5	Q05979	453 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	NDL1	Q06568	189 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YFH1	Q07540	174 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	REX3	Q12090	404 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PSY3	Q12318	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ALG1	P16661	449 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	NAS2	P40555	220 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PHO86	P46956	311 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	BUG1	Q12191	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	HNM1	P19807	563 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ECM25	P32525	599 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	STN1	P38960	494 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PES4	P39684	611 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	GAT2	P40209	560 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YIR016W	P40572	265 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ADA2	Q02336	434 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	SYO1	Q07395	620 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	UBX3	Q12229	455 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RUP1	Q12242	671 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PHO91	P27514	894 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	VPS52	P39904	641 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	AZF1	P41696	914 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	GUF1	P46943	645 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MDV1	P47025	714 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YIP5	P53108	310 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ROG1	P53118	685 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PCP1	P53259	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	IRC15	Q02733	499 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	TAF12	Q03761	539 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RBA50	Q04418	439 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	RSM22	P36056	628 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	GPI16	P38875	610 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YIL089W	P40500	205 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YPS6	P40583	537 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	AQR1	P53943	586 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	STP1	Q00947	519 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	YEH2	Q07950	538 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	SRN2	Q99176	213 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YKL177W	YKL177W	FRE2	P36033	711 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	YCR041W	P37265	110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	MNL1	P38888	796 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	ELP2	P42935	788 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	GPI8	P49018	411 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	SHE4	P51534	789 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	YIP1	P53039	248 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	YNL143C	P53908	130 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	PNG1	Q02890	363 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YKL177W	YKL177W	SPH1	Q06160	661 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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