RNA–Protein interactions for RNA: YKL108W

SLD2, Transcript of Single-stranded DNA origin-binding and annealing protein, yeast

Gene SLD2, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLD2	YKL108W	GSH2	Q08220	491 aa		5	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		5	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	EFM2	P38347	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	ARN1	P38731	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SSO2	P39926	295 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SDS3	P40505	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	AVT1	P47082	602 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	PKP2	P53170	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	TIM44	Q01852	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SMA1	Q02651	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	TMN2	Q04562	672 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SMA2	Q04658	369 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SRN2	Q99176	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SCEI	P03882	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	TYR1	P20049	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
SLD2	YKL108W	YSC83	P32792	385 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	REC114	P32841	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YUH1	P35127	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	QDR3	P38227	689 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	OPY1	P38271	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	STN1	P38960	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	GND2	P53319	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	HSP31	Q04432	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YLH47	Q06493	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SRB8	P25648	1427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	GSY2	P27472	705 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YBR139W	P38109	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	LAG1	P38703	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	END3	P39013	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	AIM20	P40451	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	PHO86	P46956	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YHC3	P47040	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	SHE10	P53075	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	ECM18	Q04623	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	PFA4	Q12006	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLD2	YKL108W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	BAR1	P12630	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CBP4	P37267	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	VRG4	P40107	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GAT2	P40209	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	AGX1	P43567	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SOL4	P53315	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	FMP30	Q02883	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	TPO3	Q06451	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	BUG1	Q12191	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	NUP170	P38181	1502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SUC2	P00724	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CDC21	P06785	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CHS1	P08004	1131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PPZ1	P26570	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YBL028C	P38202	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YHR177W	P38867	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	UBP8	P50102	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	DSL1	P53847	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	TLG1	Q03322	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	ARP10	Q04549	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SWF1	Q04629	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	STE23	Q06010	1027 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	RRT8	Q08219	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	HSL1	P34244	1518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	POL1	P13382	1468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	EDE1	P34216	1381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	GAL3	P13045	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PSO2	P30620	661 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	STP2	P38704	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YEL020C	P39994	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YJR154W	P47181	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	YGR266W	P53326	701 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	STD1	Q02794	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	SSK1	Q07084	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	NSE1	Q07913	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLD2	YKL108W	PEX27	Q08580	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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