RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W AAT2P23542 418 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W VMA16P23968 213 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ELO2P25358 347 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YCL049CP25577 312 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YPS1P32329 569 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W HIR2P32480 875 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data0.06□□□□□ -2.4not detected
RDS3YPR094W SHP1P34223 423 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ALY1P36117 915 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRPL36P36531 177 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PFF1P38244 976 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W CIN4P39110 191 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W AFG3P39925 761 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W GAT2P40209 560 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W HIS6P40545 261 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W STB1P42845 420 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W LAM5P43560 674 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W UPF3P48412 387 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W APT1P49435 187 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YIP5P53108 310 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NRM1P53718 249 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ARC35P53731 342 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SLG1P54867 378 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ADA2Q02336 434 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YMR102CQ03177 834 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W COQ9Q05779 260 aa0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NUC1P08466 329 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YAR066WP0CX18 203 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YHR214WP0CX19 203 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRP13P12686 339 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W EST1P17214 699 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SLY1P22213 666 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ATP11P32453 318 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W UTR5P32630 166 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W GRX4P32642 244 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YBR144CP34215 104 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W UBP11P36026 717 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W GRX7P38068 203 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W OM14P38325 134 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PAF1P38351 445 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W FPR3P38911 411 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W OXA1P39952 402 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W VPS27P40343 622 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SYG1P40528 902 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YJL144WP47009 104 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YGR127WP53275 312 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W FOL1P53848 824 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PDS5Q04264 1277 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NDE2Q07500 545 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MUM3Q08750 479 aa0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SNX3Q08826 162 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YLR302CO13544 120 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TEF1P02994 458 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SCH9P11792 824 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W UBC1P21734 215 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SNT1P25357 1226 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRP20P32387 263 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W SSE2P32590 693 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MUD1P32605 298 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YCR041WP37265 110 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W GPI18P38211 433 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ALK1P43633 760 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W FAR3P46671 204 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W AIM22P47051 409 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YJR030CP47101 745 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W TOF2Q02208 771 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YMR181CQ03231 154 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YET2Q04210 160 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MCH1Q07376 486 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YPL272CQ08984 517 aa0.04□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YPR096CO13587 100 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W GAL1P04385 528 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MTF2P10849 440 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W NAM2P11325 894 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W PUT4P15380 627 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RPI1P23250 407 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W CDC50P25656 391 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ECM25P32525 599 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W ECT1P33412 323 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YKL133CP36066 463 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W REG2P38232 338 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W FRT2P39734 528 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MDE1P47095 244 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W BNS1P50084 137 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W YGR067CP53243 804 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W MRPL13Q02204 264 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W HOT1Q03213 719 aa0.03□□□□□ -2.4
RDS3YPR094W RCO1Q04779 684 aa0.03□□□□□ -2.4
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