RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	DTR1	P38125	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	FAD1	P38913	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	APQ12	P40532	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MAD2	P40958	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SPT20	P50875	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	TEL2	P53038	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MON1	P53129	644 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YNL165W	P53891	406 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ATG21	Q02887	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	BCH1	Q05029	724 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RSA1	Q08932	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	PUS9	Q12069	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YRM1	Q12340	786 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ERG11	P10614	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SPS100	P13130	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MRPL33	P20084	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ATP12	P22135	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SPS22	P25380	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	CDC5	P32562	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RTT107	P38850	1070 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MEF2	P39677	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SCC4	P40090	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	NEO1	P40527	1151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	PAC11	P40960	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RAD17	P48581	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RTA1	P53047	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SPP2	Q02521	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	GIS1	Q03833	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	CRR1	Q05790	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ATG23	Q06671	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SLD7	Q08457	257 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MCH5	Q08777	521 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MLH3	Q12083	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SRN2	Q99176	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	STE12	P13574	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ATE1	P16639	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	PHO13	P19881	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	PTC6	P25646	442 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YBR071W	P38243	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YBR197C	P38306	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	EFM1	P38732	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	HAT2	P39984	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	FMP52	P40008	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	VRG4	P40107	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SNO3	P43544	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MNN5	P46982	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MDV1	P47025	714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	SKP1	P52286	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ROG1	P53118	685 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YNL260C	P53846	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	BOP3	P53958	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ERG5	P54781	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	PNP1	Q05788	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ICT1	Q12385	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	STE3	P06783	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ERG9	P29704	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ZIP1	P31111	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YMR134W	P40207	237 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	QDR2	P40474	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	AZF1	P41696	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MAL11	P53048	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	VPS75	P53853	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	TIM10	P87108	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	HDA2	Q06629	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YEH1	Q07804	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	IMA2	Q08295	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	APN1	P22936	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ISC10	P32645	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	HES1	P35843	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YNL296W	YNL296W	MSS4	P38994	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms