RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPS7	Q06325	596 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YPQ2	Q06328	317 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ENV9	Q08651	330 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TRM10	Q12400	293 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PCL9	Q12477	304 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CAT8	P39113	1433 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ADR1	P07248	1323 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SPO23	P33757	523 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SRY1	P36007	326 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SRO77	P38163	1010 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YEN1	P40028	759 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PGD1	P40356	397 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MND2	P40577	368 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	THI12	P42883	340 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	THI5	P43534	340 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CAF16	P43569	289 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VPS25	P47142	202 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	THI11	P47183	340 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HST3	P53687	447 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CPR8	P53728	308 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FPK1	P53739	893 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RMI1	Q02685	241 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	THI13	Q07748	340 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNF3	P10870	884 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NIT1	P40447	199 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HXT9	P40885	567 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MEP2	P41948	499 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YAP6	Q03935	383 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CDA2	Q06703	312 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	AHC1	Q12433	566 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ARP6	Q12509	438 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	NUC1	P08466	329 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MRP13	P12686	339 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ERD1	P16151	362 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SEC59	P20048	519 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	DRE2	P36152	348 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MSS4	P38994	779 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YJL068C	P40363	299 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GUF1	P46943	645 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YHC3	P47040	408 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BOL2	P53082	120 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VAC7	P53950	1165 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RCN2	Q12044	265 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RKM5	Q12367	367 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	HIS5	P07172	385 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CWH43	P25618	953 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	QDR1	P40475	563 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BAP3	P41815	604 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BIR1	P47134	954 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	RCF2	P53721	224 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YMR209C	Q03648	457 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GIM5	Q04493	163 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MLH3	Q12083	715 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	YRM1	Q12340	786 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TPK1	P06244	397 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	MET3	P08536	511 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	BIO2	P32451	375 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	OAR1	P35731	278 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TAD1	P53065	400 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GMC1	Q04399	608 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	URA6	P15700	204 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	PCL1	P24867	279 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	COS111	P38308	924 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TOF2	Q02208	771 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	TVP15	Q03860	143 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	EMI1	Q04406	187 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	FLC1	Q08967	793 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	GTT2	Q12390	233 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SNF8	Q12483	233 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TOM1	YDR457W	SGF29	P25554	259 aa		2.69	□□□□□ -1.98

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