RNA–Protein interactions for RNA: YNL198C

YNL198C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL198C, Length 303 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL198C	YNL198C	DIA3	P52290	468 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	NRM1	P53718	249 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	MRP51	Q02950	344 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	NDE2	Q07500	545 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	YOL114C	Q12322	202 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	COX4	P04037	155 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	PRY2	P36110	329 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	SPC72	P39723	622 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	IME4	P41833	600 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	COG1	P53079	417 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	YGR126W	P53274	230 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	MSC1	Q03104	513 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	YDR239C	Q03780	787 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	RAD61	Q99359	647 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	BUR6	P40096	142 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	YFL012W	P43580	148 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	SSN8	P47821	323 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	PEX14	P53112	341 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL198C	YNL198C	SAG1	P20840	650 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	CLB4	P24871	460 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	NUP133	P36161	1157 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PUG1	P40100	303 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	SEC9	P40357	651 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PSK2	Q08217	1101 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	MRP13	P12686	339 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	BOS1	P25385	244 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RIB5	P38145	238 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	VPS4	P52917	437 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YPS5	P53057	165 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YGR127W	P53275	312 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	COX17	Q12287	69 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RKM5	Q12367	367 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	BUB3	P26449	341 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	IES6	P32617	166 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	MRPL36	P36531	177 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	HXT11	P54862	567 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	TMA17	Q12513	150 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	TPK1	P06244	397 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	SYN8	P31377	255 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	MST28	P39552	234 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YIP5	P53108	310 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	NUS1	Q12063	375 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	ERG8	P24521	451 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YCR100C	P25606	316 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	AGA2	P32781	87 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	CSE2	P33308	149 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	CIN4	P39110	191 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	FRT2	P39734	528 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PTR3	P43606	678 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	FAR3	P46671	204 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	EFM6	P53970	246 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	MUB1	Q03162	620 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YMR181C	Q03231	154 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	SKG3	Q06315	1026 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PSR1	Q07800	427 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	JID1	Q12350	301 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	IZH2	Q12442	317 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	UTR5	P32630	166 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	PFF1	P38244	976 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RTC2	P38279	296 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YJL144W	P47009	104 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YNL198C	YNL198C	YPR096C	O13587	100 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	GAT2	P40209	560 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	YMR102C	Q03177	834 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PPM1	Q04081	328 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	CYC3	P06182	269 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PRR1	P28708	518 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	ICS2	P38284	255 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	PGU1	P47180	361 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	REG1	Q00816	1014 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	MUM3	Q08750	479 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YNL198C	YNL198C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 1006 ms