RNA–Protein interactions for RNA: YLR288C

MEC3, Transcript of DNA damage and meiotic pachytene checkpoint protein, yeast

Gene MEC3, Length 1,425 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MEC3	YLR288C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	YGL114W	P53134	725 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	COX18	P53239	316 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	GPN3	Q06543	272 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	DSE3	Q08729	430 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RLM1	Q12224	676 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SPE1	P08432	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	URA4	P20051	364 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	APA2	P22108	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	PPH22	P23595	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	CYM1	P32898	989 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SWC5	P38326	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RCY1	P39531	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	BNA6	P43619	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	YHC3	P47040	408 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	URB2	P47108	1174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
MEC3	YLR288C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	INA17	Q02888	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RSM24	Q03976	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	URH1	Q04179	340 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	GIM5	Q04493	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	TLG2	Q08144	397 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	VIK1	Q12045	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	GET4	Q12125	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SRN2	Q99176	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	YOS9	Q99220	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	URK1	P27515	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ZIP1	P31111	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SIP1	P32578	815 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SRB5	P32585	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RSM22	P36056	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	NUP133	P36161	1157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	YHR112C	P38716	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	PRM9	P39551	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	JJJ3	P47138	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	COS5	P47187	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ASI2	P53895	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	BET4	Q00618	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RTT103	Q05543	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RRG8	Q06109	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	COS7	Q07788	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	NRT1	Q08485	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	VTH1	P40438	1549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	VTH2	P40890	1549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	CHS2	P14180	963 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ADH7	P25377	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	STE14	P32584	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	TOS1	P38288	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	BIT61	P47041	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	YIP5	P53108	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SLT2	Q00772	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	FIN1	Q03898	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	CAB5	Q03941	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	APC4	Q04601	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	NNT1	Q05874	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SIL1	Q08199	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	FMP16	Q12497	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	DFG16	Q99234	619 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	SPO14	P36126	1683 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MEC3	YLR288C	POL1	P13382	1468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	AI3	P03877	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	TUP1	P16649	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	SPE2	P21182	396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	ATP11	P32453	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	HIR2	P32480	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	SPR1	P32603	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	MAL32	P38158	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	EHT1	P38295	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MEC3	YLR288C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
MEC3	YLR288C	YIR042C	P40586	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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