RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR047W	YKR047W	CYB2	P00175	591 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ATP10	P18496	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SMI1	P32566	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	DUG2	P38149	878 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	POP1	P41812	875 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SNO3	P43544	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	NMD5	P46970	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	CAC2	Q04199	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	HIF1	Q12373	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RIP1	P08067	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	TYR1	P20049	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
YKR047W	YKR047W	BEM1	P29366	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SNC1	P31109	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	WSS1	P38838	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ECM27	P47144	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	POS5	Q06892	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SSK1	Q07084	712 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YPR089W	O13585	888 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	STF1	P01098	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MBR1	P23493	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	KRE2	P27809	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ATP11	P32453	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	DAD2	P36162	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	FLO10	P36170	1169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	FAD1	P38913	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ATF1	P40353	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YJR154W	P47181	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	TOF1	P53840	1238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YNL234W	P53857	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SEC5	P89102	971 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RSC9	Q03124	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	PPM1	Q04081	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MTR10	Q99189	972 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	BAR1	P12630	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	REC114	P32841	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SIF2	P38262	535 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	LEU5	P38702	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	VHS2	P40463	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YPT11	P48559	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ALT2	P52892	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	OCA2	P53949	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RHO4	Q00246	291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	NUP100	Q02629	959 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	DIC1	Q06143	298 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	PDE2	P06776	526 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RHB1	P25378	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	GYP6	P32806	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	UIP5	P36137	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	CBP4	P37267	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SCO2	P38072	301 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	YSW1	P38280	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SYG1	P40528	902 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	TOM22	P49334	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	MLC1	P53141	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SMA1	Q02651	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	VTC3	Q02725	835 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	RRD2	Q12461	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YKR047W	YKR047W	SUC2	P00724	532 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	SIN4	P32259	974 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	FLO5	P38894	1075 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	YTA12	P40341	825 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	EPL1	P43572	832 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	GAT1	P43574	510 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	EKI1	Q03764	534 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	CRC1	Q12289	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YKR047W	YKR047W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.1 ms