RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	NBP2	Q12163	236 aa		3.26	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SWI1	P09547	1314 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	HEM2	P05373	342 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	APE1	P14904	514 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YCR022C	P25620	114 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	MAL33	P38157	468 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SPG5	P42933	373 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	RAD30	Q04049	632 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SSP2	Q08646	371 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	TCO89	Q08921	799 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	CTI6	Q08923	506 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	REV1	P12689	985 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YKL100C	P34248	587 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	CSM2	P40465	213 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	PTR3	P43606	678 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	MSC1	Q03104	513 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	RRN3	P36070	627 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	NUP133	P36161	1157 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	ECM29	P38737	1868 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SNG1	P46950	547 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	EFM6	P53970	246 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SHR3	Q02774	210 aa		3.23	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	MRP7	P12687	371 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	PEP5	P12868	1029 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	IMG1	P25626	169 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	PFF1	P38244	976 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YPI1	P43587	155 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YJL132W	P47014	750 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YML131W	Q03102	365 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	SYO1	Q07395	620 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.22	□□□□□ -1.89	not detected
PEX18	YHR160C	MYO1	P08964	1928 aa		3.22	□□□□□ -1.89
PEX18	YHR160C	FLO1	P32768	1537 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SGF29	P25554	259 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ICS2	P38284	255 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
PEX18	YHR160C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	WSC2	P53832	503 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YSA1	Q01976	231 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ERO1	Q03103	563 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YDL057W	Q07379	328 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SDH5	Q08230	162 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SAC3	P46674	1301 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	MOT1	P32333	1867 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	BOS1	P25385	244 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	FRE1	P32791	686 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SWH1	P35845	1188 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	IDP2	P41939	412 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	BSC5	P53755	489 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	CSI1	Q04368	295 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SKM1	Q12469	655 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	KAR3	P17119	729 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YBR144C	P34215	104 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	UBP11	P36026	717 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	PMU1	P36069	295 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SHO1	P40073	367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	ALT2	P52892	507 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	LCL3	P53153	274 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YGR126W	P53274	230 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YGR127W	P53275	312 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SLD5	Q03406	294 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	BNA5	Q05979	453 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	SPE4	Q12455	300 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	FLO11	P08640	1367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PEX18	YHR160C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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