RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RCN1	P36054	211 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YBR139W	P38109	508 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	KTR4	P38131	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	APM3	P38153	483 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TVP23	P38962	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
UBX7	YBR273C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YAR028W	P39548	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SWD1	P39706	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MTW1	P39731	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SIT1	P39980	628 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	DDI1	P40087	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	JLP2	P40206	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	IME4	P41833	600 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	NUP85	P46673	744 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SIP4	P46954	829 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YGR035C	P53222	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YNR063W	P53749	607 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	CAF120	P53836	1060 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RRN5	Q02983	363 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RSC9	Q03124	581 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PIR3	Q03180	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	VTA1	Q06263	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	REH1	Q06709	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MDM36	Q06820	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	COS7	Q07788	383 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	THP1	Q08231	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MED2	Q12124	431 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SUT2	Q12286	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SCM3	Q12334	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AI3	P03877	415 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ARG81	P05085	880 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PET122	P10355	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GAL3	P13045	520 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	CBS2	P14905	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MRPL8	P22353	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	NTG1	P31378	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	THI80	P35202	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YKR051W	P36142	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YBR056W	P38081	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	IPT1	P38954	527 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	EMP65	P40085	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PSF2	P40359	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	KTR7	P40504	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GTS1	P40956	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	UFE1	P41834	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	AIM23	P47015	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ROM1	P53046	1155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	COG1	P53079	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TUB4	P53378	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	IPI3	P53877	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	YML083C	Q04526	418 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	APC4	Q04601	652 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RCN2	Q12044	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MLH3	Q12083	715 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	RPN13	O13563	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	HMG2	P12684	1045 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MET8	P15807	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	DAP2	P18962	818 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SGE1	P33335	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TIP20	P33891	701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	HCS1	P34243	683 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GLG1	P36143	616 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SLX1	P38324	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	UBA4	P38820	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	ERV46	P39727	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	FCY21	P40039	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SYG1	P40528	902 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	GYP8	P43570	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	PTR3	P43606	678 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	SPO74	P45819	413 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UBX7	YBR273C	EFM3	P47163	339 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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