RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	MIX23	P38162	196 aa		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	RKM5	Q12367	367 aa		2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	TOM20	P35180	183 aa		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	STB6	P36085	766 aa		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	PRM5	P40476	318 aa		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	POP6	P53218	158 aa		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	SSM4	P40318	1319 aa		2.66	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	BUB3	P26449	341 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	UBP11	P36026	717 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	PSY4	P38193	441 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SIP4	P46954	829 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	HER2	Q03557	464 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	YPL199C	Q08954	240 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		2.65	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	TOF2	Q02208	771 aa		2.64	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	YIH1	P25637	258 aa		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SLC1	P33333	303 aa		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	MSG5	P38590	489 aa		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	MDG1	P53885	366 aa		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	RAD30	Q04049	632 aa		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	FDH1	Q08911	376 aa		2.63	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	PRE8	P23639	250 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SPS22	P25380	463 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	AXL2	P38928	823 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	NCA3	P46955	337 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	COQ9	Q05779	260 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	CCH1	P50077	2039 aa		2.62	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	MNS1	P32906	549 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	ODC1	Q03028	310 aa		2.61	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	MRP13	P12686	339 aa		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	YCR100C	P25606	316 aa		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	KKQ8	P36004	724 aa		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SAP185	P40856	1058 aa		2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SGS1	P35187	1447 aa		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	YKL097C	P34245	136 aa		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	AFG3	P39925	761 aa		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	GTR1	Q00582	310 aa		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	YML037C	Q03703	340 aa		2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
VAR1	Q0140	ELO2	P25358	347 aa		2.58	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	MRPL10	P36520	322 aa		2.58	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	AIM22	P47051	409 aa		2.58	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	SPE4	Q12455	300 aa		2.58	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.58	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	NUP2	P32499	720 aa		2.57	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	PTH2	P34222	208 aa		2.57	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	VID24	P38263	362 aa		2.57	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	BRO1	P48582	844 aa		2.57	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	RIB5	P38145	238 aa		2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	YBR225W	P38321	900 aa		2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	CBK1	P53894	756 aa		2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	MRP51	Q02950	344 aa		2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	KAR3	P17119	729 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	ATP11	P32453	318 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	SEF1	P34228	1148 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	BMT2	P38278	337 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	MSR1	P38714	643 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	GAB1	P41733	394 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	URB2	P47108	1174 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	YGR021W	P53212	290 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	MTM1	P53320	366 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	IPI3	P53877	555 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	PNG1	Q02890	363 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	IES4	Q08561	116 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	SKM1	Q12469	655 aa		2.55	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	PRB1	P09232	635 aa		2.54	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	YSA1	Q01976	231 aa		2.54	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	IRC25	Q07951	179 aa		2.54	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	RAD61	Q99359	647 aa		2.54	□□□□□ -2
VAR1	Q0140	COR1	P07256	457 aa		2.53	□□□□□ -2

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