RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	SLX8	P40072	274 aa		6.15	□□□□□ -1.42
RPS1B	YML063W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	AMS1	P22855	1083 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	ORC6	P38826	435 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	SAS4	Q04003	481 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	YRR1	Q12172	810 aa		6.14	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	GEF1	P37020	779 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	HPC2	Q01448	625 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	CSC1	Q06538	782 aa		6.13	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	6.13	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	STR2	P47164	639 aa		6.12	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	TFB4	Q12004	338 aa		6.12	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	ECM5	Q03214	1411 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	PEX21	P50091	288 aa		6.11	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	MDS3	P53094	1487 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	BUD4	P47136	1447 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	ISM1	P48526	1002 aa		6.1	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	COX6	P00427	148 aa		6.09	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
RPS1B	YML063W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	NUD1	P32336	851 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	MAM3	Q12296	706 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	GLC3	P32775	704 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	PEP1	P32319	1579 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	ATG2	P53855	1592 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	SLD2	P34252	453 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TRK1	P12685	1235 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPS1B	YML063W	SEC2	P17065	759 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	RGR1	P19263	1082 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	REV3	P14284	1504 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	DIT2	P21595	489 aa		6	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	NPL4	P33755	580 aa		6	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	IES2	P40154	320 aa		6	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	ATF2	P53296	535 aa		6	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	YPR109W	Q06104	294 aa		6	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	TOP1	P04786	769 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	BRL1	P38770	471 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	RGA1	P39083	1007 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	CST6	P40535	587 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	MRX12	P47084	519 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	TFB3	Q03290	321 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	ERG12	P07277	443 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	SSN2	P38931	1420 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPS1B	YML063W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	HEM3	P28789	327 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	CLA4	P48562	842 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	LAM6	Q08001	693 aa		5.95	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	SIN3	P22579	1536 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	MET10	P39692	1035 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	RRN7	P40992	514 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	ERF2	Q06551	359 aa		5.93	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	KEX2	P13134	814 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	BPT1	P14772	1559 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	SSK2	P53599	1579 aa		5.92	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	ESP1	Q03018	1630 aa		5.91	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	BIM1	P40013	344 aa		5.9	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	DOS2	P54858	310 aa		5.9	□□□□□ -1.46
RPS1B	YML063W	BDP1	P46678	594 aa		5.89	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	YTA7	P40340	1379 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	TAF2	P23255	1407 aa		5.88	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	PKC1	P24583	1151 aa		5.87	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
RPS1B	YML063W	CLB5	P30283	435 aa		5.86	□□□□□ -1.47

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