RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	MRX10	Q05648	414 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	MDG1	P53885	366 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	MRPL32	P25348	183 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	PPG1	P32838	368 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	REV3	P14284	1504 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	RAD59	Q12223	238 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	TSR4	P25040	408 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	STS1	P38637	319 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	YHL050C	P38721	697 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	YHR219W	P38900	624 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
SYF1	YDR416W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	STB3	Q12427	513 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	SEC8	P32855	1065 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	KIC1	P38692	1080 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	HSL1	P34244	1518 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	PPX1	P38698	397 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	RIM21	P48565	533 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	WHI5	Q12416	295 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	YDR416W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	YCK3	P39962	524 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	MDJ2	P42834	146 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	HST2	P53686	357 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ALG12	P53730	551 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	CIT2	P08679	460 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	PEP1	P32319	1579 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	PEP12	P32854	288 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	TPM2	P40414	161 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	YJR107W	P47145	328 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ECM23	Q02710	187 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	KAR5	Q04746	504 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	IOC3	P43596	787 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ORC6	P38826	435 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	FPK1	P53739	893 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	NIS1	P53939	407 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	BUD4	P47136	1447 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	VAC8	P39968	578 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	MDS3	P53094	1487 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	MMP1	Q12372	583 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ESS1	P22696	170 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	CLB5	P30283	435 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	RAD54	P32863	898 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.3	□□□□□ -1.56	RIP-Chip
SYF1	YDR416W	MGE1	P38523	228 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	THI12	P42883	340 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	THI5	P43534	340 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	THI11	P47183	340 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	THI13	Q07748	340 aa		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	YFR006W	P43590	535 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ALD3	P54114	506 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	RGR1	P19263	1082 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	MET1	P36150	593 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	GRX4	P32642	244 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	RPN4	Q03465	531 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	YMR196W	Q04336	1088 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	YDR416W	ARG8	P18544	423 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YJU3	P28321	313 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	MNL2	Q12205	849 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	ECM5	Q03214	1411 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	SCJ1	P25303	377 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	MNN4	P36044	1178 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	UBX7	P38349	436 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	ATG1	P53104	897 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.27	□□□□□ -1.57	not detected
SYF1	YDR416W	GAL2	P13181	574 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	NSE3	Q05541	303 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	BUD6	P41697	788 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YPP1	P46951	817 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YJL049W	P47048	450 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YGL081W	P53156	320 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	KTR7	P40504	517 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YGR273C	P53329	174 aa		5.25	□□□□□ -1.57

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