RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.86■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 NEO1Q92859 1461 aa26.85■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.85■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.83■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.82■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 AKNAQ7Z591 1439 aa26.82■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 PREX2Q70Z35 1606 aa26.81■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.8■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.78■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.78■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.76■■□□□ 1.88
CLN6-218ENST00000637223 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CLN6-218ENST00000637223 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CLN6-218ENST00000637223 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.72■■□□□ 1.87
CLN6-218ENST00000637223 PTPRMP28827 1452 aa26.71■■□□□ 1.87
CLN6-218ENST00000637223 RAPGEF3O95398 923 aa26.71■■□□□ 1.87
CLN6-218ENST00000637223 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.7■■□□□ 1.86
CLN6-218ENST00000637223 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CLN6-218ENST00000637223 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
CLN6-218ENST00000637223 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CLN6-218ENST00000637223 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.66■■□□□ 1.86
CLN6-218ENST00000637223 ABCC1P33527 1531 aa26.65■■□□□ 1.86
CLN6-218ENST00000637223 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.63■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.6■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.6■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.59■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 AFAP1Q8N556 730 aa26.59■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.59■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 MIA2Q96PC5 1412 aa26.58■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CLN6-218ENST00000637223 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.57■■□□□ 1.84
CLN6-218ENST00000637223 RICTORQ6R327 1708 aa26.57■■□□□ 1.84
CLN6-218ENST00000637223 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.56■■□□□ 1.84
CLN6-218ENST00000637223 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.55■■□□□ 1.84
CLN6-218ENST00000637223 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.52■■□□□ 1.84
CLN6-218ENST00000637223 MBD5Q9P267 1494 aa26.51■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.5■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.5■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 MADDQ8WXG6 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.49■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 KDM5CP41229 1560 aa26.49■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.48■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 HSPA2P54652 639 aa26.47■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.47■■□□□ 1.83
CLN6-218ENST00000637223 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.45■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.44■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.44■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.44■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.42■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.41■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.41■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 CERKQ8TCT0 537 aa26.39■■□□□ 1.82
CLN6-218ENST00000637223 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 TSPY4P0CV99 314 aa26.36■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 TSPY10P0CW01 314 aa26.36■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 ATP7AQ04656 1500 aa26.35■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 ABCC5O15440 1437 aa26.35■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 ATP10AO60312 1499 aa26.34■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.33■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.33■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 DAPK1P53355 1430 aa26.33■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 ABCA6Q8N139 1617 aa26.33■■□□□ 1.81
CLN6-218ENST00000637223 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.31■■□□□ 1.8
CLN6-218ENST00000637223 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.31■■□□□ 1.8
CLN6-218ENST00000637223 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CLN6-218ENST00000637223 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CLN6-218ENST00000637223 ILDR2Q71H61 639 aa26.27■■□□□ 1.8
CLN6-218ENST00000637223 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.26■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.26■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.25■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.25■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 ITGAEP38570 1179 aa26.25■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 MLECQ14165 292 aa26.24■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.23■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 A2MP01023 1474 aa26.22■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.22■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 SOCS7O14512 581 aa26.21■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 PTPRKQ15262 1439 aa26.21■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 REREQ9P2R6 1566 aa26.2■■□□□ 1.79
CLN6-218ENST00000637223 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.17■■□□□ 1.78
CLN6-218ENST00000637223 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CLN6-218ENST00000637223 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.16■■□□□ 1.78
CLN6-218ENST00000637223 PLXNC1O60486 1568 aa26.16■■□□□ 1.78
CLN6-218ENST00000637223 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.15■■□□□ 1.78
CLN6-218ENST00000637223 KIF15Q9NS87 1388 aa26.15■■□□□ 1.78
CLN6-218ENST00000637223 AGLP35573 1532 aa26.14■■□□□ 1.77
CLN6-218ENST00000637223 NCOA1Q15788 1441 aa26.13■■□□□ 1.77
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