RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612413.4

ANAPC11-223, Transcript of anaphase promoting complex subunit 11, human

TSL 3 BASIC

Gene ANAPC11, Length 964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANAPC11-223	ENST00000612413	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.61	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.6	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ANAPC11-223	ENST00000612413	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.55	■■■□□ 2.64
ANAPC11-223	ENST00000612413	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ANAPC11-223	ENST00000612413	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.52	■■■□□ 2.64
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCC1	P33527	1531 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.48	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.47	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	KDM5C	P41229	1560 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ANAPC11-223	ENST00000612413	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	APLP2	Q06481	763 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.4	■■■□□ 2.62
ANAPC11-223	ENST00000612413	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ANAPC11-223	ENST00000612413	ATP10A	O60312	1499 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ANAPC11-223	ENST00000612413	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
ANAPC11-223	ENST00000612413	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.22	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ANAPC11-223	ENST00000612413	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ANAPC11-223	ENST00000612413	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ANAPC11-223	ENST00000612413	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ANAPC11-223	ENST00000612413	AGL	P35573	1532 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ANAPC11-223	ENST00000612413	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ANAPC11-223	ENST00000612413	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.02	■■■□□ 2.56
ANAPC11-223	ENST00000612413	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.56
ANAPC11-223	ENST00000612413	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	PLXNC1	O60486	1568 aa		31	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	A2M	P01023	1474 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		30.98	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		30.98	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	PTPRM	P28827	1452 aa		30.98	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	TSPY4	P0CV99	314 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	TSPY10	P0CW01	314 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ANAPC11-223	ENST00000612413	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ANAPC11-223	ENST00000612413	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		30.91	■■■□□ 2.54
ANAPC11-223	ENST00000612413	MLEC	Q14165	292 aa		30.9	■■■□□ 2.54
ANAPC11-223	ENST00000612413	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	30.9	■■■□□ 2.54
ANAPC11-223	ENST00000612413	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	30.9	■■■□□ 2.54
ANAPC11-223	ENST00000612413	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	30.87	■■■□□ 2.53
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCC5	O15440	1437 aa		30.87	■■■□□ 2.53
ANAPC11-223	ENST00000612413	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		30.86	■■■□□ 2.53
ANAPC11-223	ENST00000612413	DAPK1	P53355	1430 aa		30.85	■■■□□ 2.53
ANAPC11-223	ENST00000612413	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		30.82	■■■□□ 2.52
ANAPC11-223	ENST00000612413	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		30.8	■■■□□ 2.52
ANAPC11-223	ENST00000612413	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		30.75	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	30.75	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	30.75	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		30.73	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	30.73	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	30.72	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	MROH2A	A6NES4	1674 aa		30.71	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	ADGRL2	O95490	1459 aa		30.7	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIF15	Q9NS87	1388 aa		30.7	■■■□□ 2.51
ANAPC11-223	ENST00000612413	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		30.69	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIF3B	O15066	747 aa		30.68	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		30.67	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	GGT6	Q6P531	493 aa		30.67	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	30.67	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	30.66	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	NCOA1	Q15788	1441 aa		30.66	■■■□□ 2.5
ANAPC11-223	ENST00000612413	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	30.64	■■■□□ 2.5

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